15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03960 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  874    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  29.77 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  25.61 
 
 		 458 aa  180  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.93 
 
 		 866 aa  113  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  21.48 
 
 		 509 aa  94.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  25.77 
 
 		 520 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2603  hypothetical protein  28.38 
 
 		 517 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  22.48 
 
 		 813 aa  86.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  24.39 
 
 		 848 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  23.85 
 
 		 542 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  26.46 
 
 		 1287 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3238  hypothetical protein  31.16 
 
 		 947 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0772641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  23.08 
 
 		 621 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  24.14 
 
 		 616 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  21.51 
 
 		 469 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>