29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1766 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1018    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  58.61 
 
 		 489 aa  594  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  57.62 
 
 		 489 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  44.35 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  31.33 
 
 		 469 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  31.79 
 
 		 505 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  31.12 
 
 		 461 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  31.52 
 
 		 470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  28.86 
 
 		 477 aa  193  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  29.96 
 
 		 502 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  26.93 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  26.77 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  26.93 
 
 		 501 aa  127  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  26.9 
 
 		 507 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  24.83 
 
 		 521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  27.07 
 
 		 457 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  27.25 
 
 		 465 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  26.9 
 
 		 515 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  23.82 
 
 		 542 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  25.68 
 
 		 782 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  24.41 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  24 
 
 		 815 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  21.64 
 
 		 616 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  24.55 
 
 		 621 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  23.77 
 
 		 718 aa  67  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  25.35 
 
 		 666 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  24.2 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  21.27 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  21.58 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>