24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2276 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1086    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  24.84 
 
 		 469 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  26.85 
 
 		 470 aa  143  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  28.8 
 
 		 505 aa  140  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  25.06 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  26.01 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  25.37 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  26.03 
 
 		 489 aa  115  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  25.69 
 
 		 499 aa  113  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  23.16 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  25.65 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  24.89 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  27.54 
 
 		 507 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  26.97 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  22.39 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  24.34 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  24.91 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  25.4 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  19.26 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  37.84 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  26.17 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  24.81 
 
 		 815 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  20.62 
 
 		 666 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  30.43 
 
 		 422 aa  47.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>