28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4606 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  953    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  58.72 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  33.55 
 
 		 501 aa  216  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  34.53 
 
 		 507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  29.31 
 
 		 502 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  29.72 
 
 		 457 aa  156  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  31.87 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  25.51 
 
 		 470 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  25.24 
 
 		 469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  25 
 
 		 499 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  27.25 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  25.58 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  24.83 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  25.88 
 
 		 489 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  27.05 
 
 		 461 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  25.27 
 
 		 815 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  22.56 
 
 		 534 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  23.44 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  24.66 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  27.57 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  24.65 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  22.44 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  27.22 
 
 		 718 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  22.29 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  25.36 
 
 		 621 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  25.37 
 
 		 782 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  23.79 
 
 		 521 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  23.24 
 
 		 496 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>