18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2834 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  88.15 
 
 		 542 aa  905    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1073    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  37.84 
 
 		 813 aa  307  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  34.95 
 
 		 509 aa  274  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2603  hypothetical protein  31.44 
 
 		 517 aa  150  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00297  hypothetical protein  22.94 
 
 		 701 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.76 
 
 		 866 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  25.77 
 
 		 422 aa  88.6  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  24.3 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  26.17 
 
 		 848 aa  75.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3216  hypothetical protein  21.11 
 
 		 655 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000265804 
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  22.49 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  22.66 
 
 		 782 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  22.81 
 
 		 815 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  23.1 
 
 		 515 aa  50.4  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  22.82 
 
 		 542 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  25.12 
 
 		 718 aa  47  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  22.96 
 
 		 666 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>