132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2642 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  67.26 
 
 		 890 aa  1237    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  67.04 
 
 		 890 aa  1233    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  58.44 
 
 		 689 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  100 
 
 		 895 aa  1846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  36.38 
 
 		 878 aa  435  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  34.52 
 
 		 955 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  34.02 
 
 		 899 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  33.59 
 
 		 950 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  33.42 
 
 		 953 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  33.17 
 
 		 958 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  33.17 
 
 		 958 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  39.72 
 
 		 582 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  33.46 
 
 		 953 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  33.13 
 
 		 955 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  33.01 
 
 		 950 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  39.37 
 
 		 591 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  33.51 
 
 		 929 aa  392  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  40.3 
 
 		 631 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  34.62 
 
 		 911 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  37.5 
 
 		 515 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  36.54 
 
 		 845 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  38.47 
 
 		 580 aa  311  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  35.78 
 
 		 676 aa  310  6.999999999999999e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  35.89 
 
 		 633 aa  308  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  31.67 
 
 		 979 aa  296  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  51.15 
 
 		 678 aa  289  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  51.48 
 
 		 681 aa  289  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  51.15 
 
 		 681 aa  288  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  37.04 
 
 		 658 aa  280  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  36.12 
 
 		 627 aa  275  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  31.79 
 
 		 841 aa  256  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  34.33 
 
 		 930 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  33.12 
 
 		 556 aa  250  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  30.63 
 
 		 1051 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  43.49 
 
 		 763 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  43.17 
 
 		 763 aa  241  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  32.18 
 
 		 711 aa  231  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  33.1 
 
 		 574 aa  231  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  43.38 
 
 		 273 aa  227  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  40.55 
 
 		 295 aa  212  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.94 
 
 		 713 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  29.59 
 
 		 553 aa  199  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  37.46 
 
 		 775 aa  189  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  37.46 
 
 		 775 aa  188  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  39.56 
 
 		 777 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  39.94 
 
 		 777 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  37.07 
 
 		 777 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  38.2 
 
 		 777 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  39.08 
 
 		 777 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  37.89 
 
 		 777 aa  174  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  36.53 
 
 		 776 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  40.18 
 
 		 280 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  154  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  31.38 
 
 		 338 aa  127  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  28.31 
 
 		 443 aa  127  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  24.72 
 
 		 580 aa  95.5  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  30.86 
 
 		 383 aa  88.2  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  34.09 
 
 		 277 aa  87.4  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1077 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  28.02 
 
 		 321 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  33.17 
 
 		 782 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  30.57 
 
 		 842 aa  82.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  29.09 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  28.62 
 
 		 897 aa  79.7  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  29.63 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  43.68 
 
 		 134 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  31.87 
 
 		 813 aa  75.1  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  31.34 
 
 		 271 aa  74.3  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  28.04 
 
 		 336 aa  73.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  31.45 
 
 		 275 aa  73.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  40 
 
 		 847 aa  73.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  33.09 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  33.09 
 
 		 848 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  28.95 
 
 		 303 aa  72  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.22 
 
 		 970 aa  72  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.57 
 
 		 970 aa  71.2  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3668  integrase family protein  43.18 
 
 		 269 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  23.87 
 
 		 1557 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  34.25 
 
 		 709 aa  70.1  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  24.77 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  22.22 
 
 		 597 aa  67.8  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  22.22 
 
 		 597 aa  67.8  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  28.8 
 
 		 278 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  27.25 
 
 		 361 aa  67  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  31.02 
 
 		 818 aa  64.7  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  34.95 
 
 		 797 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  27.05 
 
 		 987 aa  63.9  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  37.59 
 
 		 986 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  41.24 
 
 		 866 aa  63.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  28.72 
 
 		 739 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  39.81 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  28.64 
 
 		 1448 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  24.75 
 
 		 297 aa  60.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  34.75 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1448 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  33.59 
 
 		 354 aa  60.1  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  29.55 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  33.59 
 
 		 621 aa  59.3  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40670  DnaG-like primase protein  33.33 
 
 		 128 aa  59.3  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>