49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3088 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  100 
 
 		 709 aa  1428    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  29.03 
 
 		 987 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  26.15 
 
 		 842 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  27.61 
 
 		 624 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  24.72 
 
 		 911 aa  92.4  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  27.34 
 
 		 658 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  29.15 
 
 		 627 aa  80.9  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  29.76 
 
 		 1051 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  28.03 
 
 		 676 aa  79.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  25.64 
 
 		 897 aa  77.8  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  27.35 
 
 		 633 aa  77  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  27.41 
 
 		 929 aa  75.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  25.61 
 
 		 711 aa  75.5  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  22.47 
 
 		 899 aa  75.1  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  31.35 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  26.39 
 
 		 582 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  27.16 
 
 		 591 aa  71.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  34.25 
 
 		 895 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  24.65 
 
 		 930 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  26.63 
 
 		 950 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  34.33 
 
 		 631 aa  69.7  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  26.36 
 
 		 958 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  27.51 
 
 		 574 aa  68.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  26.36 
 
 		 958 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  26.36 
 
 		 953 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  26.36 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  29.33 
 
 		 689 aa  67.8  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  26.36 
 
 		 950 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  30.1 
 
 		 841 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  26.68 
 
 		 953 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  31.65 
 
 		 890 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  31.65 
 
 		 890 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  23.34 
 
 		 713 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  27.78 
 
 		 955 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  27.05 
 
 		 979 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  22.26 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  21.21 
 
 		 597 aa  62  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  21.21 
 
 		 597 aa  62  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  31.39 
 
 		 515 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  25.56 
 
 		 878 aa  59.7  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  24.9 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  26.87 
 
 		 553 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  29.03 
 
 		 443 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  26.02 
 
 		 845 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.35 
 
 		 970 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.35 
 
 		 970 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  23.6 
 
 		 298 aa  47.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  23.6 
 
 		 298 aa  47.4  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  26.34 
 
 		 383 aa  44.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>