54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0070 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1202    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  74.61 
 
 
591 aa  924    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  57.43 
 
 
631 aa  658    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  40.92 
 
 
911 aa  435  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  39.72 
 
 
895 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  38.78 
 
 
689 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  36.06 
 
 
950 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  36.27 
 
 
955 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  35.75 
 
 
953 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  35.01 
 
 
955 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  35.01 
 
 
950 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  35.75 
 
 
958 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  35.75 
 
 
958 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  39.18 
 
 
890 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  39.18 
 
 
890 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  35.75 
 
 
953 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  65.22 
 
 
280 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  54.51 
 
 
295 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  37.7 
 
 
676 aa  327  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  38.12 
 
 
930 aa  324  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  38.16 
 
 
633 aa  316  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  37.48 
 
 
580 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  35.95 
 
 
845 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  35.92 
 
 
658 aa  299  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  34.74 
 
 
841 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  31.96 
 
 
979 aa  278  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  34.76 
 
 
515 aa  273  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  36.75 
 
 
627 aa  263  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  33.27 
 
 
1051 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  30.72 
 
 
711 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  32.87 
 
 
574 aa  220  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  31.84 
 
 
878 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  30.35 
 
 
899 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  28.84 
 
 
556 aa  210  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2286  hypothetical protein  90.18 
 
 
125 aa  207  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  29.94 
 
 
553 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  29.17 
 
 
929 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.72 
 
 
713 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  25.64 
 
 
580 aa  107  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  35.56 
 
 
383 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  25.85 
 
 
443 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  25.55 
 
 
842 aa  92.8  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  29.63 
 
 
897 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  27.34 
 
 
597 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  26.98 
 
 
597 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  26.98 
 
 
597 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  40.37 
 
 
134 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  26.39 
 
 
709 aa  72  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.3 
 
 
970 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.3 
 
 
970 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  37.14 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  37.14 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  27.44 
 
 
987 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  24.22 
 
 
624 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>