129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2368 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  100 
 
 		 878 aa  1788    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  62.91 
 
 		 929 aa  1152    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  59.53 
 
 		 711 aa  697    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  66.56 
 
 		 899 aa  1209    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  63.12 
 
 		 713 aa  770    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  36.38 
 
 		 895 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  35.41 
 
 		 890 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  35.19 
 
 		 890 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  75.9 
 
 		 383 aa  320  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  49.09 
 
 		 763 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  48.78 
 
 		 763 aa  268  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  32.65 
 
 		 689 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  50.69 
 
 		 273 aa  245  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  44.05 
 
 		 678 aa  243  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  32.9 
 
 		 591 aa  243  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  39.49 
 
 		 681 aa  241  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  39.75 
 
 		 681 aa  240  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  27.99 
 
 		 911 aa  232  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  31.84 
 
 		 582 aa  231  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  28.69 
 
 		 950 aa  223  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  28.76 
 
 		 953 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  28.71 
 
 		 953 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  28.84 
 
 		 958 aa  221  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  28.84 
 
 		 958 aa  221  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  30.86 
 
 		 631 aa  216  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  33.15 
 
 		 580 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  31.76 
 
 		 676 aa  209  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  27.48 
 
 		 955 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  27.01 
 
 		 950 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  30.6 
 
 		 633 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  31.34 
 
 		 627 aa  190  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2724  hypothetical protein  74.07 
 
 		 127 aa  183  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  31.68 
 
 		 930 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  28.34 
 
 		 955 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  28.02 
 
 		 658 aa  170  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  29.73 
 
 		 1051 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  29.91 
 
 		 556 aa  164  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  28.66 
 
 		 845 aa  161  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  37.54 
 
 		 775 aa  160  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  33.42 
 
 		 515 aa  159  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  25.86 
 
 		 979 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  38.04 
 
 		 775 aa  156  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  36.89 
 
 		 777 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  34.34 
 
 		 295 aa  147  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  30.42 
 
 		 841 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  29.92 
 
 		 574 aa  144  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  36 
 
 		 777 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  36 
 
 		 777 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  33.64 
 
 		 777 aa  142  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  28.06 
 
 		 553 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  35.53 
 
 		 777 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  33.13 
 
 		 776 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  34.26 
 
 		 368 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  32 
 
 		 777 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  29.67 
 
 		 338 aa  113  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  32.68 
 
 		 280 aa  104  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  27.69 
 
 		 842 aa  97.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  30.04 
 
 		 309 aa  95.5  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  36.06 
 
 		 782 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  29.52 
 
 		 336 aa  89.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  44.36 
 
 		 278 aa  87.8  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  29.69 
 
 		 336 aa  84  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  34.64 
 
 		 813 aa  83.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  36.99 
 
 		 277 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  26.02 
 
 		 321 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  36.77 
 
 		 1448 aa  77.8  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  36.77 
 
 		 1448 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  36.18 
 
 		 275 aa  77  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  37.42 
 
 		 848 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  37.82 
 
 		 272 aa  76.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  37.68 
 
 		 1077 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  30.47 
 
 		 986 aa  75.5  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  35.29 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  40.28 
 
 		 744 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  30.65 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  31.79 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  37.98 
 
 		 746 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  29.82 
 
 		 354 aa  73.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  38.58 
 
 		 1580 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  28.96 
 
 		 897 aa  72.4  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  29.49 
 
 		 621 aa  72  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  31.84 
 
 		 1557 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.47 
 
 		 334 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  40 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  43.53 
 
 		 866 aa  68.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  28.35 
 
 		 987 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3668  integrase family protein  43.48 
 
 		 269 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  33.16 
 
 		 1389 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  25.35 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  31.31 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  37.23 
 
 		 847 aa  64.7  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  32.32 
 
 		 818 aa  64.7  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  28.16 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000018393  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  27.32 
 
 		 411 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  24.3 
 
 		 580 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1495 aa  63.9  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  37.38 
 
 		 797 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  28.71 
 
 		 736 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  29.05 
 
 		 739 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  42.03 
 
 		 355 aa  62  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>