56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1505 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  100 
 
 
633 aa  1298    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  52.06 
 
 
627 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  40.16 
 
 
658 aa  438  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  42.83 
 
 
676 aa  435  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  38.56 
 
 
631 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  38.16 
 
 
582 aa  316  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  36.91 
 
 
591 aa  310  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  35.93 
 
 
895 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  34.25 
 
 
955 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  34.36 
 
 
950 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  37.95 
 
 
953 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  37.95 
 
 
955 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  34.36 
 
 
958 aa  301  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  34.36 
 
 
958 aa  301  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  37.95 
 
 
950 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  34.53 
 
 
953 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  36.08 
 
 
689 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  35.53 
 
 
890 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  35.53 
 
 
890 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  37.16 
 
 
930 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  31.62 
 
 
911 aa  270  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  35.45 
 
 
580 aa  259  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  34.5 
 
 
979 aa  253  8.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  34.12 
 
 
845 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  31.68 
 
 
841 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  30.52 
 
 
1051 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  32.73 
 
 
556 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  35.05 
 
 
515 aa  210  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  29.8 
 
 
899 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  31.53 
 
 
574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  31.28 
 
 
711 aa  196  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  29.2 
 
 
929 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  30.32 
 
 
553 aa  190  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.93 
 
 
713 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  30.6 
 
 
878 aa  180  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  32.39 
 
 
443 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  37.11 
 
 
295 aa  146  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  38.8 
 
 
280 aa  137  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.33 
 
 
970 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.74 
 
 
970 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  29.23 
 
 
580 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  34.97 
 
 
383 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  26.97 
 
 
842 aa  92.8  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  27.22 
 
 
987 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  25.53 
 
 
597 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  25.53 
 
 
597 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  25.6 
 
 
597 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  27.35 
 
 
709 aa  77  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  29.31 
 
 
897 aa  77  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  21.8 
 
 
624 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  43.42 
 
 
134 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  28.57 
 
 
298 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  28.57 
 
 
298 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.75 
 
 
1002 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.12 
 
 
1006 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0501  hypothetical protein  26.18 
 
 
647 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000301954  normal  0.0595539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>