45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0360 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  100 
 
 		 443 aa  898    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  32.39 
 
 		 633 aa  169  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  32.31 
 
 		 955 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  31.97 
 
 		 627 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  31.84 
 
 		 953 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  30.47 
 
 		 676 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  31.61 
 
 		 955 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  31.02 
 
 		 658 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  31.61 
 
 		 950 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  31.61 
 
 		 958 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  31.61 
 
 		 958 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  31.39 
 
 		 953 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  31.83 
 
 		 950 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  28.25 
 
 		 591 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  28.31 
 
 		 895 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  28.91 
 
 		 631 aa  127  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  26.34 
 
 		 911 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  27.58 
 
 		 890 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  27.58 
 
 		 890 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  28.82 
 
 		 689 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  30.18 
 
 		 930 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  28.79 
 
 		 845 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  25.85 
 
 		 582 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  28.21 
 
 		 841 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  28.24 
 
 		 556 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  27.56 
 
 		 580 aa  97.8  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  31.84 
 
 		 280 aa  93.2  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  30.38 
 
 		 1051 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  24.3 
 
 		 979 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  25.65 
 
 		 515 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  23.99 
 
 		 711 aa  81.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  29.32 
 
 		 929 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.88 
 
 		 970 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.62 
 
 		 970 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  29.29 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  34.09 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  28.42 
 
 		 899 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.89 
 
 		 713 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  31.11 
 
 		 574 aa  61.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  30.65 
 
 		 878 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  25.31 
 
 		 987 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  29.03 
 
 		 709 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  27 
 
 		 580 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  23.72 
 
 		 842 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  28.57 
 
 		 295 aa  43.5  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>