54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1225 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  100 
 
 		 515 aa  1063    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  37.5 
 
 		 895 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  38.21 
 
 		 890 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  38.21 
 
 		 890 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  36.8 
 
 		 689 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  34.76 
 
 		 582 aa  273  6e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  35.24 
 
 		 841 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  33.6 
 
 		 591 aa  267  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  36.46 
 
 		 631 aa  266  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  32.87 
 
 		 958 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  32.87 
 
 		 958 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  32.8 
 
 		 953 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  33.05 
 
 		 950 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  32.6 
 
 		 950 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  32.6 
 
 		 955 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  36.44 
 
 		 930 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  32.39 
 
 		 953 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  32.6 
 
 		 955 aa  256  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  38.62 
 
 		 580 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  35.57 
 
 		 845 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  32.78 
 
 		 911 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  36.73 
 
 		 676 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  34.33 
 
 		 658 aa  229  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  32.08 
 
 		 979 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  35.05 
 
 		 633 aa  210  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  34.29 
 
 		 627 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  31.25 
 
 		 556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  31.66 
 
 		 1051 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  31.83 
 
 		 574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  32.67 
 
 		 711 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  31.61 
 
 		 929 aa  147  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  29.44 
 
 		 899 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  33.42 
 
 		 878 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  27.21 
 
 		 553 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  37.75 
 
 		 295 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.51 
 
 		 713 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  32.94 
 
 		 280 aa  120  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  27.04 
 
 		 580 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.27 
 
 		 970 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.2 
 
 		 970 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  25.65 
 
 		 443 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  27.44 
 
 		 987 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  29.04 
 
 		 897 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  27.63 
 
 		 842 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  31.1 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  22.43 
 
 		 624 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  23.53 
 
 		 597 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  23.53 
 
 		 597 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  31.39 
 
 		 709 aa  60.5  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  23.53 
 
 		 597 aa  60.1  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  31.21 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  31.21 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2286  hypothetical protein  30.36 
 
 		 125 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>