54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2819 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  100 
 
 		 676 aa  1370    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  44.34 
 
 		 627 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  42.93 
 
 		 633 aa  445  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  39.11 
 
 		 658 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  40.88 
 
 		 631 aa  350  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  37.7 
 
 		 582 aa  336  7.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  36.64 
 
 		 591 aa  323  7e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  35.78 
 
 		 895 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  37.18 
 
 		 689 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  35.79 
 
 		 955 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  36.31 
 
 		 890 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  35.79 
 
 		 950 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  36.31 
 
 		 890 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  35.79 
 
 		 950 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  35.79 
 
 		 958 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  35.79 
 
 		 958 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  35.79 
 
 		 953 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  35.79 
 
 		 953 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  35.44 
 
 		 955 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  32.84 
 
 		 911 aa  287  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  38.64 
 
 		 845 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  33.03 
 
 		 979 aa  274  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  34.45 
 
 		 580 aa  254  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  36.73 
 
 		 515 aa  249  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  32.99 
 
 		 930 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 929 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  34.67 
 
 		 841 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  30.53 
 
 		 899 aa  219  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  29.1 
 
 		 1051 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  29.62 
 
 		 711 aa  211  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  31.76 
 
 		 878 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.83 
 
 		 713 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  32.13 
 
 		 574 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  30.57 
 
 		 556 aa  188  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  28.34 
 
 		 553 aa  177  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  38.25 
 
 		 295 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  30.47 
 
 		 443 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  40.49 
 
 		 280 aa  164  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.97 
 
 		 970 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  26.47 
 
 		 580 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  33.16 
 
 		 383 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.75 
 
 		 970 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  26.92 
 
 		 842 aa  90.9  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  28 
 
 		 709 aa  84.3  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  24.35 
 
 		 624 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  28.7 
 
 		 987 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  27.74 
 
 		 897 aa  74.3  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  22.89 
 
 		 597 aa  70.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  22.41 
 
 		 597 aa  70.5  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  22.41 
 
 		 597 aa  70.5  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  41.11 
 
 		 134 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  30.71 
 
 		 298 aa  57  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  30.71 
 
 		 298 aa  57  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2724  hypothetical protein  32.69 
 
 		 127 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>