124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3881 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  66.45 
 
 		 899 aa  1228    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  62.91 
 
 		 878 aa  1143    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  100 
 
 		 929 aa  1911    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  61.26 
 
 		 711 aa  742    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  67.52 
 
 		 713 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  33.62 
 
 		 895 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  33.83 
 
 		 890 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  33.72 
 
 		 890 aa  396  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  93.3 
 
 		 383 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  29.98 
 
 		 911 aa  256  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  31.61 
 
 		 689 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  30.36 
 
 		 591 aa  223  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  27.84 
 
 		 950 aa  221  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  27.78 
 
 		 953 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  33.64 
 
 		 580 aa  217  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  27.9 
 
 		 958 aa  217  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  27.9 
 
 		 958 aa  217  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  30.78 
 
 		 631 aa  217  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  28.29 
 
 		 953 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  31.55 
 
 		 676 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  38.75 
 
 		 678 aa  213  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2724  hypothetical protein  88.07 
 
 		 127 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  38.75 
 
 		 681 aa  211  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  40.18 
 
 		 763 aa  209  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  40.18 
 
 		 763 aa  208  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  27.53 
 
 		 955 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  38.46 
 
 		 681 aa  206  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  27.53 
 
 		 950 aa  204  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  29.17 
 
 		 582 aa  204  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  39.88 
 
 		 273 aa  194  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  29.2 
 
 		 633 aa  191  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  32.55 
 
 		 627 aa  188  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  31.21 
 
 		 930 aa  183  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  26.81 
 
 		 979 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  28.4 
 
 		 955 aa  179  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  28.86 
 
 		 1051 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  32.01 
 
 		 556 aa  172  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  30.7 
 
 		 658 aa  171  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  27.77 
 
 		 845 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  32.7 
 
 		 574 aa  154  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  30.6 
 
 		 841 aa  153  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  33.62 
 
 		 775 aa  152  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  33.62 
 
 		 777 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  33.04 
 
 		 775 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  31.61 
 
 		 515 aa  146  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  33.53 
 
 		 777 aa  145  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  30.11 
 
 		 553 aa  144  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  32.46 
 
 		 777 aa  132  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  32.75 
 
 		 777 aa  131  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  32.04 
 
 		 776 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  32.78 
 
 		 295 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  32.46 
 
 		 777 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  31.12 
 
 		 777 aa  122  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  30.33 
 
 		 368 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  28.48 
 
 		 338 aa  107  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  29.93 
 
 		 842 aa  102  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  33.61 
 
 		 280 aa  100  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3668  integrase family protein  52.17 
 
 		 269 aa  99  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  38.07 
 
 		 326 aa  87.8  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  33.2 
 
 		 1448 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1448 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  37.58 
 
 		 813 aa  79.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  33.04 
 
 		 986 aa  77.8  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  27.41 
 
 		 709 aa  75.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  31.4 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  30.57 
 
 		 782 aa  76.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1580 aa  75.1  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  34.39 
 
 		 848 aa  75.1  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  33.54 
 
 		 746 aa  74.7  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  29.47 
 
 		 443 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  35.23 
 
 		 272 aa  72  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  28.9 
 
 		 987 aa  72.4  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  27.53 
 
 		 897 aa  72.4  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  32.53 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  26.91 
 
 		 336 aa  70.5  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  35.85 
 
 		 275 aa  70.5  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  36.42 
 
 		 621 aa  70.5  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  36.57 
 
 		 354 aa  70.5  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  28.37 
 
 		 744 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  33.48 
 
 		 357 aa  69.7  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  27.69 
 
 		 1557 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1495 aa  68.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  32.04 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  39.77 
 
 		 309 aa  66.6  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  32.74 
 
 		 835 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  36.21 
 
 		 326 aa  67  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  30.41 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  35.4 
 
 		 736 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  31.87 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0048  hypothetical protein  78.95 
 
 		 40 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.51 
 
 		 866 aa  65.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  37.37 
 
 		 847 aa  65.5  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  44.93 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  35.17 
 
 		 1077 aa  65.1  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  27.27 
 
 		 1389 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  25.84 
 
 		 334 aa  63.9  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  27.23 
 
 		 1255 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  23.15 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  32.37 
 
 		 408 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.27 
 
 		 970 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>