57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2613 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  100 
 
 		 987 aa  2051    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  30.9 
 
 		 842 aa  249  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  29.03 
 
 		 709 aa  154  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  24.43 
 
 		 624 aa  142  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  30.35 
 
 		 866 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  30.43 
 
 		 820 aa  126  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  31.13 
 
 		 841 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  27.22 
 
 		 633 aa  90.1  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  24.89 
 
 		 979 aa  89  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  27.63 
 
 		 911 aa  88.2  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  27.44 
 
 		 515 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  28.66 
 
 		 890 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  28.66 
 
 		 890 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  28.7 
 
 		 676 aa  83.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  27.53 
 
 		 769 aa  81.6  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  26.54 
 
 		 591 aa  79.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  28.9 
 
 		 929 aa  79  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  22.62 
 
 		 897 aa  78.2  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  29.46 
 
 		 580 aa  76.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  26.74 
 
 		 582 aa  76.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  28.24 
 
 		 899 aa  75.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  28.87 
 
 		 631 aa  74.3  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  27.32 
 
 		 895 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  26.67 
 
 		 711 aa  71.6  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  31.68 
 
 		 556 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  29.67 
 
 		 658 aa  68.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  27.51 
 
 		 689 aa  68.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  28.01 
 
 		 627 aa  67  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  29.84 
 
 		 845 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  30.58 
 
 		 1051 aa  65.1  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  25.97 
 
 		 958 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.92 
 
 		 713 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  25.97 
 
 		 958 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  30.23 
 
 		 874 aa  62.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  30.23 
 
 		 874 aa  62.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  25.97 
 
 		 953 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  25.97 
 
 		 955 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  25.45 
 
 		 955 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  25.97 
 
 		 953 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  28.21 
 
 		 950 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  25.97 
 
 		 950 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  25.51 
 
 		 443 aa  62  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3490  hypothetical protein  29.67 
 
 		 813 aa  59.7  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  28.35 
 
 		 878 aa  59.3  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  31.25 
 
 		 930 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  27.16 
 
 		 574 aa  58.9  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4702  hypothetical protein  32.64 
 
 		 891 aa  57.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  30.26 
 
 		 553 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  26.34 
 
 		 978 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  23.96 
 
 		 597 aa  54.3  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  28.49 
 
 		 597 aa  53.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  28.49 
 
 		 597 aa  53.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  30.91 
 
 		 383 aa  53.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  34.58 
 
 		 697 aa  48.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  26.86 
 
 		 1061 aa  47  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  22.59 
 
 		 580 aa  47  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  31.33 
 
 		 825 aa  45.8  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>