22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2898 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  100 
 
 
825 aa  1682    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  44.37 
 
 
681 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  35.62 
 
 
751 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  32.19 
 
 
493 aa  191  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  31.62 
 
 
846 aa  155  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  28.62 
 
 
526 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  25 
 
 
756 aa  93.2  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  23.42 
 
 
769 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  26.24 
 
 
724 aa  81.3  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  27.62 
 
 
833 aa  81.3  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  26.43 
 
 
689 aa  80.9  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  25.84 
 
 
920 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  22.9 
 
 
444 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  25.48 
 
 
866 aa  55.8  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0468  hypothetical protein  24.17 
 
 
566 aa  54.7  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1907  hypothetical protein  25.93 
 
 
485 aa  53.5  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.27137  hitchhiker  0.000000104796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  26.52 
 
 
679 aa  52  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0325  hypothetical protein  34.44 
 
 
188 aa  48.9  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.606726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  32.82 
 
 
978 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  31.33 
 
 
987 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  27.57 
 
 
796 aa  44.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1980  hypothetical protein  26.8 
 
 
405 aa  44.3  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.576893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>