24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2457 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  100 
 
 		 820 aa  1679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  27.94 
 
 		 866 aa  145  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  29.76 
 
 		 756 aa  140  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  30.43 
 
 		 987 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  25.54 
 
 		 833 aa  83.2  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  38.03 
 
 		 874 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  38.03 
 
 		 874 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  25.63 
 
 		 920 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  22.53 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  23.8 
 
 		 1039 aa  51.6  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  24.5 
 
 		 689 aa  50.8  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2317  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 464 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  26.12 
 
 		 681 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4702  hypothetical protein  35.05 
 
 		 891 aa  49.7  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  25.16 
 
 		 846 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  23.46 
 
 		 724 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  32.5 
 
 		 679 aa  49.3  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  23.29 
 
 		 444 aa  48.5  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  29.79 
 
 		 769 aa  48.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  24.42 
 
 		 751 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  28.76 
 
 		 771 aa  45.8  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  24.35 
 
 		 493 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  25.63 
 
 		 879 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1980  hypothetical protein  27.95 
 
 		 405 aa  44.3  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.576893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>