85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02077 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  100 
 
 		 979 aa  2029    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  32.19 
 
 		 841 aa  349  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  31.89 
 
 		 930 aa  323  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  31.38 
 
 		 845 aa  302  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  31.78 
 
 		 950 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  31.72 
 
 		 958 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  31.72 
 
 		 958 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  31.72 
 
 		 950 aa  297  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  31.72 
 
 		 953 aa  298  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  31.72 
 
 		 955 aa  297  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  31.55 
 
 		 955 aa  296  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  31.67 
 
 		 895 aa  296  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  31.37 
 
 		 953 aa  294  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  30.49 
 
 		 890 aa  287  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  30.49 
 
 		 890 aa  287  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  32.73 
 
 		 591 aa  286  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  31.96 
 
 		 582 aa  278  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  31.63 
 
 		 631 aa  271  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  33.03 
 
 		 676 aa  264  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  29.23 
 
 		 911 aa  252  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  34.5 
 
 		 633 aa  253  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  28.99 
 
 		 689 aa  252  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  32.61 
 
 		 658 aa  227  9e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  32.08 
 
 		 515 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  28.4 
 
 		 1051 aa  218  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  28.71 
 
 		 556 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  29.89 
 
 		 580 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  29.43 
 
 		 627 aa  205  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  29.76 
 
 		 553 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  28.9 
 
 		 574 aa  187  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  25.81 
 
 		 899 aa  182  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  27.23 
 
 		 711 aa  179  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 929 aa  179  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.92 
 
 		 713 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  38.89 
 
 		 280 aa  163  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  35.69 
 
 		 834 aa  147  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  38.62 
 
 		 739 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  25.86 
 
 		 878 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  35.77 
 
 		 838 aa  141  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  27.19 
 
 		 295 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  45.77 
 
 		 272 aa  121  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  30.43 
 
 		 383 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  24.3 
 
 		 443 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  39.2 
 
 		 351 aa  89  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  36.3 
 
 		 847 aa  88.6  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  26.98 
 
 		 731 aa  86.7  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.63 
 
 		 970 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  27.74 
 
 		 682 aa  85.5  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  27.4 
 
 		 842 aa  85.5  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.43 
 
 		 970 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  24.24 
 
 		 580 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  29.1 
 
 		 712 aa  81.6  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  29.72 
 
 		 716 aa  81.6  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  27.27 
 
 		 892 aa  81.6  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  30.03 
 
 		 712 aa  80.9  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  29.1 
 
 		 712 aa  80.1  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  29.41 
 
 		 712 aa  80.1  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  30.97 
 
 		 720 aa  77.8  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  28.67 
 
 		 760 aa  76.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  23.95 
 
 		 987 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  22.12 
 
 		 597 aa  73.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  23.4 
 
 		 597 aa  73.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  23.4 
 
 		 597 aa  73.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1537  hypothetical protein  37.89 
 
 		 103 aa  68.9  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7053  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  65.1  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.496846  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4213  hypothetical protein  41.11 
 
 		 112 aa  65.1  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.936932  normal  0.431658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  27.88 
 
 		 765 aa  64.7  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  24.73 
 
 		 624 aa  63.9  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  27.05 
 
 		 709 aa  63.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  33.33 
 
 		 759 aa  62  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  26.49 
 
 		 738 aa  61.6  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  27.55 
 
 		 755 aa  61.6  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  26.12 
 
 		 897 aa  58.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7732  hypothetical protein  40.28 
 
 		 102 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  31.39 
 
 		 298 aa  56.6  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  31.39 
 
 		 298 aa  56.6  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  33.98 
 
 		 654 aa  55.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  29.41 
 
 		 867 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  31.55 
 
 		 437 aa  53.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7197  hypothetical protein  30.23 
 
 		 302 aa  53.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.860673  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  25.66 
 
 		 701 aa  50.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  34.44 
 
 		 696 aa  46.2  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  25.43 
 
 		 732 aa  46.2  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  32.03 
 
 		 815 aa  44.3  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>