89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0810 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  100 
 
 		 930 aa  1853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  38.72 
 
 		 841 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  37.95 
 
 		 845 aa  446  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  38.12 
 
 		 582 aa  335  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  39.71 
 
 		 631 aa  335  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  31.89 
 
 		 979 aa  331  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  37.13 
 
 		 591 aa  329  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  36.72 
 
 		 890 aa  294  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  36.72 
 
 		 890 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  33.57 
 
 		 911 aa  290  9e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  35.13 
 
 		 953 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  35.48 
 
 		 955 aa  282  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  37.16 
 
 		 633 aa  281  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  34.67 
 
 		 958 aa  281  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  34.67 
 
 		 958 aa  281  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  34.96 
 
 		 950 aa  281  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  34.96 
 
 		 955 aa  281  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  34.67 
 
 		 953 aa  279  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  34.61 
 
 		 950 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  34.33 
 
 		 895 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  36.03 
 
 		 515 aa  267  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  34.98 
 
 		 689 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  35.66 
 
 		 580 aa  248  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  32.99 
 
 		 676 aa  241  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  34.46 
 
 		 627 aa  237  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  31.42 
 
 		 658 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  33.41 
 
 		 556 aa  195  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  30.34 
 
 		 711 aa  190  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  31.21 
 
 		 929 aa  190  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  28.65 
 
 		 1051 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  29.77 
 
 		 899 aa  184  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  46.67 
 
 		 739 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.34 
 
 		 713 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  38.8 
 
 		 295 aa  173  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  29.79 
 
 		 553 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  30.66 
 
 		 574 aa  168  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  31.68 
 
 		 878 aa  168  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  47.03 
 
 		 272 aa  146  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  39.05 
 
 		 280 aa  142  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.42 
 
 		 970 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.88 
 
 		 970 aa  119  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  36.32 
 
 		 760 aa  118  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  30.18 
 
 		 443 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  33.55 
 
 		 759 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  38.22 
 
 		 351 aa  114  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  41.99 
 
 		 765 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  34.55 
 
 		 755 aa  109  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  40.51 
 
 		 847 aa  106  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  34.25 
 
 		 731 aa  104  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  37.76 
 
 		 716 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  44.67 
 
 		 838 aa  102  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  40 
 
 		 712 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  33.17 
 
 		 682 aa  101  8e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  42 
 
 		 834 aa  98.6  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  37.06 
 
 		 720 aa  97.8  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  37.78 
 
 		 712 aa  97.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  37.78 
 
 		 712 aa  96.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  37.78 
 
 		 712 aa  96.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  28.01 
 
 		 580 aa  94.7  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  51.16 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  34.24 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  27.23 
 
 		 842 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  54.88 
 
 		 665 aa  77.4  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  24.65 
 
 		 709 aa  70.5  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  32.45 
 
 		 654 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  30.85 
 
 		 892 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  25 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  45.88 
 
 		 320 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  26.84 
 
 		 597 aa  67  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  26.84 
 
 		 597 aa  67  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  24.51 
 
 		 624 aa  66.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  29.57 
 
 		 897 aa  65.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  43.24 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7197  hypothetical protein  30.67 
 
 		 302 aa  60.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.860673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  40.66 
 
 		 299 aa  56.6  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  35.42 
 
 		 298 aa  56.6  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  35.42 
 
 		 298 aa  56.6  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  38.78 
 
 		 895 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2286  hypothetical protein  32.73 
 
 		 125 aa  55.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  32.84 
 
 		 696 aa  55.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  28.64 
 
 		 718 aa  52.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  31.25 
 
 		 987 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  35.29 
 
 		 880 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  35.63 
 
 		 815 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  32.59 
 
 		 867 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  32.61 
 
 		 732 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0870  hypothetical protein  24.73 
 
 		 352 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0236411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  28.67 
 
 		 738 aa  45.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  27.45 
 
 		 701 aa  45.1  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>