79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4214 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  100 
 
 		 845 aa  1708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  37.95 
 
 		 930 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  35.59 
 
 		 841 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  37.78 
 
 		 631 aa  342  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  37.39 
 
 		 890 aa  337  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  37.39 
 
 		 890 aa  337  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  31.26 
 
 		 979 aa  330  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  36.54 
 
 		 895 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  34.67 
 
 		 950 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  35.95 
 
 		 582 aa  321  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  35.58 
 
 		 591 aa  317  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  33.7 
 
 		 953 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  33.7 
 
 		 958 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  33.7 
 
 		 958 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  33.44 
 
 		 953 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  34.27 
 
 		 955 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  36.52 
 
 		 689 aa  314  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  34.27 
 
 		 950 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  32.96 
 
 		 955 aa  313  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  38.64 
 
 		 676 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  35.57 
 
 		 515 aa  263  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  34.12 
 
 		 633 aa  262  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  29.98 
 
 		 911 aa  261  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  33.98 
 
 		 658 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  33.39 
 
 		 580 aa  235  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  32.63 
 
 		 627 aa  231  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  29.96 
 
 		 556 aa  190  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  36.45 
 
 		 295 aa  182  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  27.04 
 
 		 1051 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  29.82 
 
 		 899 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  27.74 
 
 		 711 aa  179  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  27.77 
 
 		 929 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  29.09 
 
 		 574 aa  165  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.77 
 
 		 713 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  38.34 
 
 		 280 aa  145  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  27.76 
 
 		 878 aa  140  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  39.64 
 
 		 739 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  27.46 
 
 		 553 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  38.21 
 
 		 272 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  28.79 
 
 		 443 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  28.57 
 
 		 580 aa  101  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  37.13 
 
 		 759 aa  93.2  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  35.27 
 
 		 765 aa  89.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  32.11 
 
 		 682 aa  89.7  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  30.08 
 
 		 847 aa  86.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  35.45 
 
 		 731 aa  85.9  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  34.72 
 
 		 760 aa  82  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  30 
 
 		 716 aa  79.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  34.19 
 
 		 834 aa  78.6  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  30.54 
 
 		 712 aa  77.4  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  32.86 
 
 		 351 aa  76.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.75 
 
 		 970 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  30.7 
 
 		 720 aa  75.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.38 
 
 		 970 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  29.73 
 
 		 712 aa  75.1  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  29.73 
 
 		 712 aa  74.7  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  29.73 
 
 		 712 aa  74.7  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  34.29 
 
 		 755 aa  74.7  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  25 
 
 		 842 aa  73.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  40.57 
 
 		 134 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  29.2 
 
 		 987 aa  72.4  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  32.31 
 
 		 838 aa  68.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  41.28 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  26.09 
 
 		 624 aa  60.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  28.4 
 
 		 897 aa  57.4  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  25.71 
 
 		 709 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  24.88 
 
 		 892 aa  54.7  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  25.29 
 
 		 597 aa  52  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  25.29 
 
 		 597 aa  52  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  25 
 
 		 597 aa  52  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  33.61 
 
 		 684 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  33.06 
 
 		 654 aa  50.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0501  hypothetical protein  28.77 
 
 		 647 aa  48.5  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000301954  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  30.77 
 
 		 725 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  30.97 
 
 		 815 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  34.92 
 
 		 718 aa  46.2  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0107  hypothetical protein  45.28 
 
 		 121 aa  44.3  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  33.04 
 
 		 895 aa  44.3  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>