More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1691 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  100 
 
 
351 aa  712    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  38.22 
 
 
930 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  35.34 
 
 
841 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  46.9 
 
 
613 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  51.46 
 
 
603 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  52.38 
 
 
604 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2883  DNA primase  64.94 
 
 
620 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.257666  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  50.49 
 
 
603 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  59.49 
 
 
623 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  59.49 
 
 
622 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1712  DNA primase  59.49 
 
 
624 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0338  DNA primase  59.49 
 
 
624 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0834  DNA primase  59.49 
 
 
624 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  59.49 
 
 
625 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  59.49 
 
 
636 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0620  DNA primase  59.49 
 
 
625 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0372  DNA primase  59.49 
 
 
624 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  59.49 
 
 
622 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1519  DNA primase  59.49 
 
 
624 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  50.49 
 
 
603 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  59.49 
 
 
800 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2526  DNA primase  59.49 
 
 
624 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2385  DNA primase  59.49 
 
 
624 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  59.49 
 
 
622 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  59.49 
 
 
625 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  46.81 
 
 
577 aa  106  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  58.23 
 
 
630 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  45.61 
 
 
659 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  58.23 
 
 
638 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  47.32 
 
 
576 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  50.57 
 
 
623 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  34.09 
 
 
739 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  46.49 
 
 
625 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  57.69 
 
 
583 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0093  DNA primase  57.83 
 
 
653 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244748  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  62.82 
 
 
617 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  43.86 
 
 
677 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  48.39 
 
 
645 aa  102  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  48.62 
 
 
660 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  48.62 
 
 
660 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  48.62 
 
 
660 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  55.91 
 
 
592 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  49.49 
 
 
582 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  50.51 
 
 
619 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  46.23 
 
 
565 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  54.43 
 
 
676 aa  99.8  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  55.7 
 
 
578 aa  99.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  57.14 
 
 
594 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3137  DNA primase  47.83 
 
 
653 aa  98.6  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  46.3 
 
 
660 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  52.58 
 
 
598 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  45.87 
 
 
651 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  51.85 
 
 
600 aa  97.4  3e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  45.83 
 
 
600 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  53.33 
 
 
579 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  57.14 
 
 
606 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  49.41 
 
 
550 aa  97.4  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  51.9 
 
 
530 aa  97.4  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  49.53 
 
 
613 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  48.86 
 
 
637 aa  97.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2484  DNA primase  46.96 
 
 
658 aa  97.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  49.37 
 
 
599 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  51.9 
 
 
660 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  44.95 
 
 
652 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1259  DNA primase  43.69 
 
 
720 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  44.74 
 
 
638 aa  96.3  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  47.5 
 
 
631 aa  95.9  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  38.99 
 
 
452 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  50.65 
 
 
662 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  48.1 
 
 
560 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  47.52 
 
 
577 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1125  DNA primase  45.16 
 
 
716 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  44.04 
 
 
663 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  47.52 
 
 
577 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  53.66 
 
 
616 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  44.04 
 
 
664 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  47.67 
 
 
588 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  51.95 
 
 
609 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  55.41 
 
 
611 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  54.67 
 
 
559 aa  94  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  27.55 
 
 
574 aa  93.6  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  42.98 
 
 
655 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  53.25 
 
 
574 aa  93.2  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  53.25 
 
 
574 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  53.25 
 
 
574 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  53.25 
 
 
574 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  27.86 
 
 
575 aa  93.2  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  53.25 
 
 
574 aa  93.2  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  53.25 
 
 
574 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  53.25 
 
 
574 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  53.25 
 
 
574 aa  93.2  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  53.25 
 
 
574 aa  93.2  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  42.61 
 
 
663 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  50.62 
 
 
623 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  48.15 
 
 
666 aa  92.4  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  53.25 
 
 
578 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  51.95 
 
 
621 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  50.62 
 
 
656 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  51.95 
 
 
588 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  28.7 
 
 
576 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>