36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0060 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 895 aa  1781    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  25.47 
 
 		 815 aa  100  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  33.45 
 
 		 684 aa  91.3  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  32.3 
 
 		 654 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  34.5 
 
 		 696 aa  77  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  33.66 
 
 		 725 aa  73.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  29.37 
 
 		 867 aa  73.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  48.05 
 
 		 141 aa  67.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  30.35 
 
 		 718 aa  66.6  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  25 
 
 		 868 aa  64.3  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  40.51 
 
 		 136 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  25 
 
 		 868 aa  64.3  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  25 
 
 		 868 aa  64.3  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  31.19 
 
 		 880 aa  62.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  45.61 
 
 		 147 aa  62.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  37.97 
 
 		 127 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  37.76 
 
 		 930 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  29.65 
 
 		 739 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  33.13 
 
 		 731 aa  54.3  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  44.93 
 
 		 759 aa  52.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  33.33 
 
 		 841 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  31.45 
 
 		 798 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  41.1 
 
 		 741 aa  51.6  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2005  hypothetical protein  39.24 
 
 		 100 aa  51.2  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.598822  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  30.08 
 
 		 278 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  33.04 
 
 		 682 aa  50.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  44.23 
 
 		 1776 aa  49.7  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  33.96 
 
 		 834 aa  49.3  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  33.53 
 
 		 765 aa  48.9  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  26.12 
 
 		 437 aa  48.5  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  32.67 
 
 		 309 aa  48.1  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  29.06 
 
 		 738 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  41.1 
 
 		 312 aa  47  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  31.94 
 
 		 760 aa  46.2  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  25.82 
 
 		 732 aa  45.8  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  24.7 
 
 		 701 aa  45.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>