49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2181 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  65.22 
 
 
582 aa  378  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  69.02 
 
 
591 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  59.93 
 
 
631 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  47.86 
 
 
911 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  42.75 
 
 
950 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  42.49 
 
 
953 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  42.12 
 
 
953 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  44.44 
 
 
955 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  44.44 
 
 
958 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  44.44 
 
 
950 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  44.44 
 
 
958 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  44.84 
 
 
955 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  43.25 
 
 
689 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  43.75 
 
 
890 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  43.75 
 
 
890 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  38.89 
 
 
979 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  40.18 
 
 
895 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  40.49 
 
 
676 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  39.05 
 
 
930 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  38.8 
 
 
633 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  39.91 
 
 
580 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  38.74 
 
 
658 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  34.86 
 
 
841 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  32.94 
 
 
515 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  38.34 
 
 
845 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  40.08 
 
 
627 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  32.41 
 
 
711 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  34.24 
 
 
574 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  32.54 
 
 
556 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  34.26 
 
 
553 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  33.61 
 
 
929 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  32.08 
 
 
899 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  35.27 
 
 
1051 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  35.36 
 
 
383 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  32.68 
 
 
878 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  31.84 
 
 
443 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.44 
 
 
713 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  32.38 
 
 
580 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  27.12 
 
 
842 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  29.79 
 
 
987 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  30.17 
 
 
897 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.24 
 
 
970 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.24 
 
 
970 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  30.65 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  30.65 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  33.56 
 
 
597 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  29.08 
 
 
597 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  29.08 
 
 
597 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>