More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1760 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  100 
 
 		 654 aa  1329    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  26.75 
 
 		 696 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  32.98 
 
 		 684 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  42.27 
 
 		 623 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  27.14 
 
 		 351 aa  80.1  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  32.3 
 
 		 895 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  28.04 
 
 		 621 aa  76.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  43.84 
 
 		 530 aa  74.3  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  37.74 
 
 		 573 aa  72.8  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  41.43 
 
 		 660 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  47.14 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  36.22 
 
 		 576 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  37.23 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  41.43 
 
 		 677 aa  72  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  41.43 
 
 		 625 aa  72  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  39.62 
 
 		 572 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1259  DNA primase  42.86 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  46.97 
 
 		 579 aa  70.9  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0093  DNA primase  41.43 
 
 		 653 aa  70.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  32.45 
 
 		 930 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0733  hypothetical protein  46.97 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 604 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  39.47 
 
 		 657 aa  69.3  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4594  DNA primase  47.76 
 
 		 632 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  41.25 
 
 		 618 aa  69.3  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  35.92 
 
 		 647 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  41.98 
 
 		 616 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  35.92 
 
 		 647 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.82 
 
 		 626 aa  69.3  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  38.57 
 
 		 676 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  42.86 
 
 		 628 aa  68.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  36.46 
 
 		 623 aa  68.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  40.79 
 
 		 629 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  32.74 
 
 		 662 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1125  DNA primase  41.43 
 
 		 716 aa  68.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  28.67 
 
 		 675 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  42.86 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  42.42 
 
 		 600 aa  68.6  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  44.78 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  32.89 
 
 		 572 aa  68.2  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  34.34 
 
 		 577 aa  68.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  41.43 
 
 		 656 aa  67.8  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.65 
 
 		 592 aa  67.8  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  34.52 
 
 		 656 aa  67.8  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  42.42 
 
 		 578 aa  67.8  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  43.94 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  36.36 
 
 		 655 aa  67  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  42.86 
 
 		 658 aa  67  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  35.87 
 
 		 636 aa  67  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  41.43 
 
 		 565 aa  67  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  41.46 
 
 		 667 aa  67  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  41.79 
 
 		 616 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  42.11 
 
 		 629 aa  67  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  34.62 
 
 		 645 aa  67  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  39.39 
 
 		 653 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1574  DNA primase  33.98 
 
 		 705 aa  67  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0270687  normal  0.0108391 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  41.43 
 
 		 565 aa  67  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  39.24 
 
 		 637 aa  67  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  37.18 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  41.79 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  43.37 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  37.14 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  42.42 
 
 		 564 aa  66.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  28.28 
 
 		 601 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  50.79 
 
 		 648 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  25.71 
 
 		 590 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  38.57 
 
 		 605 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  39.13 
 
 		 646 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  39.13 
 
 		 646 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  41.79 
 
 		 632 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  37 
 
 		 580 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  44 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  38.24 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  27.67 
 
 		 588 aa  65.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  23.47 
 
 		 731 aa  65.9  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  40 
 
 		 599 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  39.73 
 
 		 619 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.96 
 
 		 600 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  33.58 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0348  DNA primase  37.62 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  40 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  29.46 
 
 		 631 aa  65.1  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.39 
 
 		 605 aa  65.1  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  33.96 
 
 		 584 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  34.62 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  38.89 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  36.36 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  36.36 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  39.74 
 
 		 651 aa  64.7  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  35.62 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  33.98 
 
 		 584 aa  64.3  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  35.71 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  27.1 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  35 
 
 		 628 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  36.49 
 
 		 639 aa  64.7  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  41.77 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  35.71 
 
 		 604 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  37.14 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0372  DNA primase  35.71 
 
 		 624 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  37.14 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>