128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3699 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  92.51 
 
 
681 aa  1296    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  100 
 
 
678 aa  1398    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  93.1 
 
 
681 aa  1303    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  72.75 
 
 
362 aa  525  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  55.69 
 
 
466 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  51.15 
 
 
895 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  46.69 
 
 
890 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  46.69 
 
 
890 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  43.03 
 
 
367 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  42.43 
 
 
763 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  44.05 
 
 
878 aa  243  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  42.14 
 
 
763 aa  242  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  44.15 
 
 
273 aa  230  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  40.6 
 
 
899 aa  216  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  36.14 
 
 
358 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  38.75 
 
 
929 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  36.1 
 
 
775 aa  193  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  36.6 
 
 
775 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  39.19 
 
 
777 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  38.24 
 
 
777 aa  174  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  36.31 
 
 
777 aa  173  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  36.02 
 
 
777 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  35.87 
 
 
776 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  36.02 
 
 
777 aa  170  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  32.78 
 
 
777 aa  165  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  32.85 
 
 
368 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  36.46 
 
 
421 aa  145  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  38.68 
 
 
647 aa  143  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  32.56 
 
 
590 aa  134  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  32.86 
 
 
407 aa  131  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  35.44 
 
 
387 aa  127  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  29.08 
 
 
338 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  35.34 
 
 
717 aa  115  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  34.76 
 
 
813 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  32.77 
 
 
375 aa  104  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  30.42 
 
 
679 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  33.5 
 
 
464 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  24.15 
 
 
569 aa  95.5  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  30.47 
 
 
756 aa  92.8  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  33 
 
 
370 aa  87.8  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  37.67 
 
 
848 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  34.55 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  37.04 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  36.99 
 
 
746 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  25.96 
 
 
797 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  29.64 
 
 
454 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  30.3 
 
 
1557 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  35.67 
 
 
782 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  32.91 
 
 
1389 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  34.73 
 
 
1448 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  34.73 
 
 
1448 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  27.31 
 
 
759 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  35.56 
 
 
739 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  25.74 
 
 
382 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  27.72 
 
 
728 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  44.71 
 
 
309 aa  76.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  32.32 
 
 
744 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  31.31 
 
 
986 aa  73.9  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  35.42 
 
 
1077 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  27.85 
 
 
404 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  44.71 
 
 
847 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  27.8 
 
 
818 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  32.05 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  26.28 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  33.33 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  33.53 
 
 
736 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3668  integrase family protein  40.66 
 
 
269 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  30.77 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  35.77 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  33.58 
 
 
1580 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  37.82 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  28.57 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  24.62 
 
 
778 aa  67.4  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  30.77 
 
 
621 aa  67  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  25.68 
 
 
336 aa  65.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  37.5 
 
 
271 aa  64.7  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  35.19 
 
 
955 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  46.15 
 
 
358 aa  63.9  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  31.1 
 
 
1495 aa  63.9  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  46.15 
 
 
358 aa  63.9  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  31.16 
 
 
297 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  34 
 
 
272 aa  63.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  30.3 
 
 
357 aa  63.9  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  34.51 
 
 
896 aa  62  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40670  DnaG-like primase protein  31.62 
 
 
128 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  36.61 
 
 
866 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  25.1 
 
 
833 aa  60.1  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  34.33 
 
 
326 aa  59.7  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  28.97 
 
 
835 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  31.41 
 
 
292 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  61.11 
 
 
355 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  34.35 
 
 
950 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  25.27 
 
 
587 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  28.19 
 
 
299 aa  55.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  31.68 
 
 
371 aa  55.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  31.61 
 
 
292 aa  54.7  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  36.57 
 
 
953 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0611  Cpp22  26.09 
 
 
430 aa  53.5  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  35.82 
 
 
958 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>