134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3707 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  100 
 
 		 681 aa  1396    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  97.8 
 
 		 681 aa  1366    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  92.51 
 
 		 678 aa  1296    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  72.52 
 
 		 362 aa  531  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  55.29 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  51.15 
 
 		 895 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  47 
 
 		 890 aa  277  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  47 
 
 		 890 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  40.71 
 
 		 367 aa  270  8.999999999999999e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  43.96 
 
 		 763 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  43.65 
 
 		 763 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  39.49 
 
 		 878 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  45.15 
 
 		 273 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  40.29 
 
 		 899 aa  221  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  35.4 
 
 		 358 aa  211  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  35.82 
 
 		 775 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 929 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  37.27 
 
 		 775 aa  193  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  40 
 
 		 777 aa  184  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  38.86 
 
 		 777 aa  180  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  38.48 
 
 		 777 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  35.22 
 
 		 776 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  38.18 
 
 		 777 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  38.18 
 
 		 777 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  37.08 
 
 		 777 aa  171  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  156  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  39.51 
 
 		 647 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  36.11 
 
 		 421 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  36.11 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  34.87 
 
 		 407 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  31.21 
 
 		 590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  35.78 
 
 		 717 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  33.09 
 
 		 375 aa  120  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  30.07 
 
 		 338 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  31.67 
 
 		 679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  37.97 
 
 		 813 aa  104  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  32.57 
 
 		 464 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  25.44 
 
 		 569 aa  101  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  29.76 
 
 		 756 aa  98.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  33 
 
 		 370 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  26.22 
 
 		 797 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  37.67 
 
 		 848 aa  87.8  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  37.78 
 
 		 275 aa  85.9  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  35.98 
 
 		 277 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  36.99 
 
 		 746 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  28.06 
 
 		 759 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  33.51 
 
 		 744 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  36.17 
 
 		 739 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  35.67 
 
 		 782 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  32.28 
 
 		 1557 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  26.32 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  32.28 
 
 		 1389 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  39.13 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  32.7 
 
 		 1448 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  29 
 
 		 454 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1448 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  31.28 
 
 		 986 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  27.54 
 
 		 728 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1077 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  40.21 
 
 		 847 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  35 
 
 		 736 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  32.69 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  25.98 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  27.08 
 
 		 818 aa  71.6  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  35.71 
 
 		 336 aa  70.1  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  26.87 
 
 		 404 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  36.21 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  25.95 
 
 		 778 aa  68.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  35.46 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  25.68 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  30.73 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3668  integrase family protein  39.56 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1580 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  50 
 
 		 361 aa  66.6  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  30.73 
 
 		 621 aa  66.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  29.92 
 
 		 271 aa  67  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  29.05 
 
 		 272 aa  66.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1495 aa  63.9  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  35.19 
 
 		 955 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  46.15 
 
 		 358 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  30.3 
 
 		 357 aa  63.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  46.15 
 
 		 358 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  34.17 
 
 		 896 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  36.61 
 
 		 866 aa  62  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  25.5 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  36.09 
 
 		 326 aa  60.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  31.25 
 
 		 292 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40670  DnaG-like primase protein  31.62 
 
 		 128 aa  59.7  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  30.34 
 
 		 835 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  29.1 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  26.63 
 
 		 833 aa  58.2  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  24.49 
 
 		 666 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  61.11 
 
 		 355 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  24.89 
 
 		 796 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  29.7 
 
 		 667 aa  55.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  31.44 
 
 		 292 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  29.09 
 
 		 620 aa  55.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>