141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0320 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  82.56 
 
 		 776 aa  1315    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  76.65 
 
 		 777 aa  1223    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  75.19 
 
 		 777 aa  1213    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  58.27 
 
 		 775 aa  906    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  58.25 
 
 		 775 aa  906    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  100 
 
 		 777 aa  1614    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  72.45 
 
 		 777 aa  1149    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  72.45 
 
 		 777 aa  1149    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  72.57 
 
 		 777 aa  1150    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  39.74 
 
 		 763 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  39.36 
 
 		 763 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  49.58 
 
 		 605 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  50.34 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  31.8 
 
 		 636 aa  211  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  35.96 
 
 		 890 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  36.28 
 
 		 890 aa  177  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  37.07 
 
 		 895 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  37.08 
 
 		 681 aa  171  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.71 
 
 		 681 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.78 
 
 		 678 aa  165  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 273 aa  131  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  32 
 
 		 878 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  33.45 
 
 		 338 aa  128  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  30.5 
 
 		 368 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 929 aa  113  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  29.86 
 
 		 899 aa  112  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  29.68 
 
 		 1172 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  29.68 
 
 		 1172 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  26.74 
 
 		 632 aa  99.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  29.54 
 
 		 1145 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  28.61 
 
 		 336 aa  94  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  23.75 
 
 		 1000 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  34.57 
 
 		 275 aa  83.2  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  28.08 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  28.27 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  45.78 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  33.76 
 
 		 1077 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  34.59 
 
 		 813 aa  75.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  32.74 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  28.11 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 334 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  28.01 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  27.39 
 
 		 1389 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  29.77 
 
 		 782 aa  72  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  22.71 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  37.86 
 
 		 355 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  26.52 
 
 		 1557 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  38.78 
 
 		 847 aa  69.3  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  26.61 
 
 		 818 aa  69.3  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  33.12 
 
 		 955 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  36.72 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  27.76 
 
 		 341 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  32.45 
 
 		 278 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  29.53 
 
 		 848 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  24.07 
 
 		 782 aa  66.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  26.53 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  30.49 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  27.03 
 
 		 717 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  40 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  29.7 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  37.62 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  37.62 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  29.7 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  34.72 
 
 		 644 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  26.25 
 
 		 717 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  29.11 
 
 		 950 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  22.25 
 
 		 771 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  25.73 
 
 		 1285 aa  62.4  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  25.42 
 
 		 621 aa  62  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  26.7 
 
 		 1448 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  37.04 
 
 		 797 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  27.6 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  31.25 
 
 		 746 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  26.38 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  39.47 
 
 		 896 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.97 
 
 		 866 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1448 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  23.21 
 
 		 738 aa  60.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  25.53 
 
 		 736 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  22.3 
 
 		 507 aa  60.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  25.88 
 
 		 828 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  33.09 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  28 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  28 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  24.86 
 
 		 695 aa  58.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  31.14 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  25.87 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  28.99 
 
 		 621 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  33.57 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  32.47 
 
 		 955 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  32.47 
 
 		 950 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  31.87 
 
 		 953 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  27.75 
 
 		 1255 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  27.56 
 
 		 615 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1495 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1580 aa  56.6  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  28.14 
 
 		 755 aa  55.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  35.96 
 
 		 835 aa  56.2  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  27.88 
 
 		 357 aa  55.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  31.25 
 
 		 958 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>