101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1556 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  681    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  71.51 
 
 		 336 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  66.77 
 
 		 336 aa  458  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  44.59 
 
 		 309 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  38.79 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  31.78 
 
 		 371 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  33.23 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  32.75 
 
 		 355 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  33.13 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  30.84 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  34.76 
 
 		 575 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.21 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.21 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  30.86 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  37.85 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  34.8 
 
 		 339 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  27.22 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  33.48 
 
 		 220 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  36.07 
 
 		 346 aa  92.8  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  38.67 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  29.52 
 
 		 293 aa  90.1  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  34.76 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  36 
 
 		 343 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  36.07 
 
 		 344 aa  85.9  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  31.54 
 
 		 777 aa  83.2  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  30.5 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  34.81 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  34.81 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  34.97 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  32.48 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  28.78 
 
 		 777 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  33.33 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  29.92 
 
 		 777 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  31.29 
 
 		 895 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  27.19 
 
 		 777 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  29.92 
 
 		 777 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  26.74 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  41.24 
 
 		 777 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  30.73 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  31.43 
 
 		 878 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6543  hypothetical protein  28.74 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  30.11 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  35.87 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  36.57 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5573  hypothetical protein  30.7 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  34.97 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  29.02 
 
 		 890 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  29.62 
 
 		 890 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  29.75 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  30.43 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  26.96 
 
 		 899 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  32.68 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  35.71 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  26.86 
 
 		 929 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  35.84 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  35.03 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  36.26 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  33.71 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  29.14 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  33.51 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  37.5 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  30.86 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  30.26 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  31.52 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  33.33 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  28.64 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  32.79 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  31.48 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.5 
 
 		 681 aa  63.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  30.73 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  31.06 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  34.34 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.43 
 
 		 681 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  24.33 
 
 		 776 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  35.15 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  29.86 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  24.12 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  31.15 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  26.02 
 
 		 775 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.62 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  26.01 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  29.5 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  33.73 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  32.29 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  34.22 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  38.14 
 
 		 847 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  28.37 
 
 		 763 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  40.27 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  28.37 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  28.37 
 
 		 763 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  31 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  27.07 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  24.39 
 
 		 639 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  34.41 
 
 		 866 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  35.4 
 
 		 271 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  26.11 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  26.11 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000018393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2200  putative DNA primase  26.25 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  23.89 
 
 		 678 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>