85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5493 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  765    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  33.71 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  29.87 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  33.24 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  33.69 
 
 		 344 aa  155  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  31.78 
 
 		 334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  28.73 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  31 
 
 		 336 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  32.7 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  30.66 
 
 		 341 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  29.86 
 
 		 355 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.61 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.61 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  36.08 
 
 		 575 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  29.68 
 
 		 361 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  33.05 
 
 		 328 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5573  hypothetical protein  27.95 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6543  hypothetical protein  28.23 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  27.73 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  33.8 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  31.44 
 
 		 339 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  31.44 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  35 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  28.57 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  27.84 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  27.84 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  37.5 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  30.48 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  25.62 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  26.92 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  28.47 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  27.89 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  31.87 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  28.63 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  42.47 
 
 		 777 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  41.1 
 
 		 775 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  25.27 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  28.17 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  28.52 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  41.1 
 
 		 776 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  34.75 
 
 		 895 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  41.1 
 
 		 775 aa  59.7  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  33.09 
 
 		 777 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  40.79 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  40.79 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  26.59 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  33.7 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  26.89 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  40.79 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  27.46 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  29.77 
 
 		 899 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  25.95 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  26.51 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  25.41 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  38.16 
 
 		 777 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.68 
 
 		 678 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2200  putative DNA primase  26.59 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  29.67 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  26.15 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  28.92 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.68 
 
 		 681 aa  53.9  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  28.21 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  27.37 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  23.78 
 
 		 351 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  36.17 
 
 		 763 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  37.33 
 
 		 681 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  38.04 
 
 		 847 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  28.09 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  27.72 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  36.17 
 
 		 763 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  26.39 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  30.16 
 
 		 878 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  27.17 
 
 		 352 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  26.88 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  25.54 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  27.4 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  37.04 
 
 		 890 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  37.04 
 
 		 890 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 929 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  27.27 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  27.81 
 
 		 276 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  27.03 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  25.08 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  25.11 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>