59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3438 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  100 
 
 		 299 aa  598  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  49.81 
 
 		 665 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  43.53 
 
 		 320 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  32.9 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  54.79 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  30.69 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  30.05 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  27.8 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  29.9 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  34.3 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  30.2 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  32.76 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  33.84 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  28.89 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  35.05 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  28.94 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  29.25 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.85 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  26.85 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  38.38 
 
 		 930 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  29.24 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  33.68 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  32.46 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  32.46 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  28.87 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  29.25 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  34.9 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  28.36 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  29.06 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  31.44 
 
 		 351 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  28.71 
 
 		 292 aa  52.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  37.5 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  31 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  25.35 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  27.8 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  33.16 
 
 		 347 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  31.25 
 
 		 346 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  29.84 
 
 		 353 aa  49.3  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  29.05 
 
 		 401 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  34.46 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  27.27 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  29.41 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  29.31 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  31.96 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  32.57 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1915  hypothetical protein  30.82 
 
 		 914 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  31.61 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  27.64 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  29.27 
 
 		 380 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  29.24 
 
 		 353 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  28 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  29.66 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  28.78 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  29.35 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  27.4 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  25 
 
 		 355 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>