80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2209 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  100 
 
 		 312 aa  633  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  83.16 
 
 		 309 aa  500  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  37.41 
 
 		 280 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  36.96 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  34.05 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  31.21 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  40 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  36.31 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  28.99 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  34.34 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  34.45 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  29.95 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  32.5 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  36.36 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  35.29 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  34.65 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  27.52 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  34.33 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  32.66 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  25.46 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  33.5 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  31.05 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  30.51 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  50.68 
 
 		 759 aa  69.3  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  30.5 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  33.17 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  31.98 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  31.98 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  37.5 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  32.04 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  33.5 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.14 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  33.67 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  28.31 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  31.68 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  48.21 
 
 		 867 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  34.65 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  53.57 
 
 		 868 aa  62.8  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  53.57 
 
 		 868 aa  62.8  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  53.57 
 
 		 868 aa  62.8  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  32.83 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  33.67 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  29.13 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  31.71 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  31.82 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  34.5 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  31.09 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  30 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  32.54 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  30 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  34.12 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  31.25 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  35.29 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  31.03 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  49.15 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  32.14 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  29.1 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  50 
 
 		 1776 aa  56.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  29.73 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  34.88 
 
 		 127 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  52.17 
 
 		 696 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  32.71 
 
 		 136 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  43.86 
 
 		 741 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  39.76 
 
 		 718 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  30.2 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  45.61 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  57.14 
 
 		 684 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  31.84 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  29.21 
 
 		 345 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  43.75 
 
 		 815 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  36.51 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0613  putative DNA primase  29.57 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  29.31 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  41.1 
 
 		 895 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  28 
 
 		 554 aa  46.6  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>