More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2069 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  63.73 
 
 		 572 aa  720    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  100 
 
 		 554 aa  1132    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  55.29 
 
 		 546 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  50.55 
 
 		 548 aa  533  1e-150  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  50 
 
 		 595 aa  509  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  47.65 
 
 		 552 aa  481  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  46.53 
 
 		 605 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  46.5 
 
 		 605 aa  458  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  46.53 
 
 		 614 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  42.03 
 
 		 550 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  39.27 
 
 		 564 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  30.1 
 
 		 592 aa  253  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  35.99 
 
 		 617 aa  247  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  31.55 
 
 		 601 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.71 
 
 		 595 aa  246  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  34.18 
 
 		 614 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.92 
 
 		 544 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  31.78 
 
 		 588 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  32.89 
 
 		 587 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  35.75 
 
 		 599 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  35.31 
 
 		 594 aa  236  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  31.35 
 
 		 598 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  33.42 
 
 		 645 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  36.87 
 
 		 539 aa  234  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  31.59 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  32.45 
 
 		 583 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.87 
 
 		 600 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  32.45 
 
 		 583 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  33.94 
 
 		 640 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  32.78 
 
 		 576 aa  233  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 604 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  33.96 
 
 		 573 aa  233  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.05 
 
 		 598 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  33.51 
 
 		 571 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  33.78 
 
 		 598 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  33.78 
 
 		 598 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  33.78 
 
 		 598 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  33.78 
 
 		 598 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  33.78 
 
 		 598 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.05 
 
 		 598 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  31.7 
 
 		 587 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  33.78 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  28.18 
 
 		 601 aa  233  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  34.77 
 
 		 591 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  32.62 
 
 		 694 aa  232  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  32.85 
 
 		 577 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  32.85 
 
 		 578 aa  230  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  31.71 
 
 		 583 aa  230  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  30.02 
 
 		 588 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  34.1 
 
 		 598 aa  229  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  34.4 
 
 		 596 aa  229  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  35.57 
 
 		 677 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  28.18 
 
 		 675 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  33.59 
 
 		 601 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  31.32 
 
 		 629 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  35.57 
 
 		 677 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  33.25 
 
 		 605 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  29.1 
 
 		 686 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  31.13 
 
 		 623 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  28.95 
 
 		 616 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  32.85 
 
 		 587 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  35.57 
 
 		 677 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  29.75 
 
 		 579 aa  227  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  34.37 
 
 		 652 aa  226  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  32.73 
 
 		 588 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.07 
 
 		 581 aa  226  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.07 
 
 		 581 aa  226  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  39.14 
 
 		 651 aa  226  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  31.81 
 
 		 571 aa  225  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  30.71 
 
 		 585 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.07 
 
 		 581 aa  226  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.07 
 
 		 581 aa  226  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.07 
 
 		 581 aa  226  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.07 
 
 		 581 aa  226  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  33.25 
 
 		 575 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  33.1 
 
 		 652 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  31.5 
 
 		 626 aa  225  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  32.93 
 
 		 613 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  32.89 
 
 		 574 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  32.11 
 
 		 595 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  32.18 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  32.18 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  33.16 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  28.94 
 
 		 682 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  32.18 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  32.47 
 
 		 679 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  34.47 
 
 		 656 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  32.18 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  28.46 
 
 		 584 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  32.18 
 
 		 581 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  32.86 
 
 		 638 aa  224  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  29.94 
 
 		 587 aa  224  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  34.17 
 
 		 636 aa  224  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  32.89 
 
 		 599 aa  224  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  32.89 
 
 		 574 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  33.51 
 
 		 575 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  32.89 
 
 		 574 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  34.92 
 
 		 590 aa  223  6e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  32.8 
 
 		 581 aa  223  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  32.89 
 
 		 574 aa  223  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>