32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0363 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  100 
 
 
127 aa  261  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  59.68 
 
 
136 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  47.56 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  39.06 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  42.17 
 
 
868 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  42.17 
 
 
868 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  42.17 
 
 
868 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  44.59 
 
 
718 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  43.01 
 
 
759 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  47.76 
 
 
867 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  37.97 
 
 
895 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  40.66 
 
 
741 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  45.07 
 
 
798 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  39.19 
 
 
815 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  34.88 
 
 
312 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  53.19 
 
 
725 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  37.33 
 
 
278 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  53.19 
 
 
880 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  36.78 
 
 
1776 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1826  hypothetical protein  34.12 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.297533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  32.93 
 
 
309 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  47.37 
 
 
293 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2005  hypothetical protein  32.93 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.598822  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  30.91 
 
 
609 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  35.21 
 
 
296 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  35.38 
 
 
586 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3034  DNA primase  47.62 
 
 
619 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.514313  normal  0.0365839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  27.89 
 
 
586 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  37.1 
 
 
599 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  36 
 
 
587 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  39.34 
 
 
588 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  39.68 
 
 
696 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>