101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3701 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 
798 aa  1660    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  47.73 
 
 
717 aa  429  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  47.95 
 
 
717 aa  426  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  47.5 
 
 
717 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  37.78 
 
 
782 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  39.72 
 
 
755 aa  320  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  38.77 
 
 
765 aa  320  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  40.52 
 
 
760 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  40.66 
 
 
759 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  38.41 
 
 
843 aa  307  5.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  37.45 
 
 
842 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  31.27 
 
 
725 aa  296  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  36.38 
 
 
524 aa  295  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  39.41 
 
 
738 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  35.81 
 
 
749 aa  294  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  37.5 
 
 
695 aa  293  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  36.99 
 
 
746 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  36.99 
 
 
746 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  35.63 
 
 
482 aa  269  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  36.28 
 
 
462 aa  264  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  34.78 
 
 
467 aa  257  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  35.55 
 
 
472 aa  255  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  34.33 
 
 
485 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  33.88 
 
 
882 aa  247  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  32.16 
 
 
723 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  32.6 
 
 
857 aa  240  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  33.33 
 
 
554 aa  238  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  33.18 
 
 
874 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  33.18 
 
 
874 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 
470 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  29.06 
 
 
900 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  30.99 
 
 
774 aa  204  8e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  32.42 
 
 
624 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  32.24 
 
 
450 aa  197  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  31.02 
 
 
955 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  33.25 
 
 
757 aa  194  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  35.03 
 
 
479 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  28.57 
 
 
613 aa  189  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  32.5 
 
 
697 aa  189  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  32.84 
 
 
788 aa  183  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  28.47 
 
 
770 aa  180  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  29.49 
 
 
526 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  29.49 
 
 
526 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  32.43 
 
 
612 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  35.85 
 
 
741 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  35.96 
 
 
759 aa  146  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  31.83 
 
 
799 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  26.57 
 
 
769 aa  132  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  29.05 
 
 
632 aa  128  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  29 
 
 
842 aa  120  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  27.19 
 
 
486 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  26.02 
 
 
828 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  24.85 
 
 
540 aa  110  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  25.24 
 
 
531 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  25.22 
 
 
606 aa  101  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  28.05 
 
 
771 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1807  hypothetical protein  30.43 
 
 
690 aa  97.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000440945  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  25.23 
 
 
978 aa  87.8  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  25.88 
 
 
624 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  23.56 
 
 
507 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3700  hypothetical protein  64.41 
 
 
65 aa  80.9  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  24.56 
 
 
1285 aa  80.9  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  23.05 
 
 
486 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  30.88 
 
 
867 aa  65.1  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  28.22 
 
 
815 aa  64.7  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  22.54 
 
 
463 aa  64.3  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  44.12 
 
 
141 aa  62.4  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  44.29 
 
 
136 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  21.9 
 
 
1172 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  21.9 
 
 
1172 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  29.5 
 
 
880 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  42.17 
 
 
147 aa  59.7  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  22.3 
 
 
501 aa  58.5  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  21.43 
 
 
739 aa  58.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  20 
 
 
1145 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  45.07 
 
 
127 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  20.38 
 
 
542 aa  56.2  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  29.34 
 
 
1061 aa  56.6  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  25 
 
 
777 aa  55.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  41.79 
 
 
868 aa  54.3  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  41.79 
 
 
868 aa  54.3  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  41.79 
 
 
868 aa  54.3  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  22.08 
 
 
1000 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  31.45 
 
 
895 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  29.13 
 
 
1776 aa  52.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  44.07 
 
 
718 aa  52.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  51.16 
 
 
293 aa  51.6  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  28.66 
 
 
1036 aa  51.6  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  23.99 
 
 
777 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  28.05 
 
 
1039 aa  50.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  52.08 
 
 
280 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  20.98 
 
 
636 aa  49.3  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  43.55 
 
 
278 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  52.08 
 
 
283 aa  47.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  23.7 
 
 
776 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  39.66 
 
 
296 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  25 
 
 
777 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  25 
 
 
777 aa  47  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  24.73 
 
 
777 aa  45.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  25.47 
 
 
775 aa  44.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>