33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3411 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  100 
 
 		 1776 aa  3576    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5820  hypothetical protein  42.94 
 
 		 1064 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5609  hypothetical protein  42.94 
 
 		 1064 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0379241  normal  0.525859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  33.46 
 
 		 880 aa  109  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  27.89 
 
 		 867 aa  108  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  31.65 
 
 		 725 aa  106  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0501  hypothetical protein  29.78 
 
 		 647 aa  104  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000301954  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.87 
 
 		 1002 aa  100  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  25 
 
 		 868 aa  90.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  25 
 
 		 868 aa  90.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  25 
 
 		 868 aa  90.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.87 
 
 		 1006 aa  87  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  24.13 
 
 		 815 aa  82.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  31.55 
 
 		 590 aa  65.9  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  34.97 
 
 		 718 aa  63.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  30.29 
 
 		 437 aa  60.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  27.68 
 
 		 759 aa  59.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  50 
 
 		 312 aa  56.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  39.51 
 
 		 278 aa  56.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  49.21 
 
 		 141 aa  56.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  50 
 
 		 309 aa  56.2  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  46.3 
 
 		 147 aa  53.5  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0075  hypothetical protein  25.33 
 
 		 397 aa  53.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  29.13 
 
 		 798 aa  52.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  37.66 
 
 		 136 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  36.78 
 
 		 127 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  44.23 
 
 		 895 aa  49.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  39.08 
 
 		 296 aa  48.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28900  hypothetical protein  24.76 
 
 		 889 aa  47.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  27.59 
 
 		 759 aa  46.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  28.74 
 
 		 741 aa  46.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  27.4 
 
 		 756 aa  46.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  27.59 
 
 		 765 aa  45.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>