31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0060 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  35.62 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  54.55 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  39.06 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  48.05 
 
 
895 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2968  hypothetical protein  49.3 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.680316  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  44.12 
 
 
798 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  41.79 
 
 
868 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  41.79 
 
 
868 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  41.79 
 
 
868 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  38.68 
 
 
278 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  43.48 
 
 
718 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  39.44 
 
 
815 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  46.27 
 
 
741 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  47.54 
 
 
867 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  55.77 
 
 
725 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  49.21 
 
 
1776 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  45.07 
 
 
759 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  46.38 
 
 
880 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3582  hypothetical protein  43.08 
 
 
494 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000410159  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  43.28 
 
 
293 aa  50.1  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  57.5 
 
 
296 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2005  hypothetical protein  34.94 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.598822  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2833  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0877743  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  39.44 
 
 
309 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  33.33 
 
 
312 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  46.55 
 
 
280 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0544  hypothetical protein  44.23 
 
 
82 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1826  hypothetical protein  35.23 
 
 
144 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.297533 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  52.63 
 
 
283 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  37.5 
 
 
684 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>