45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2267 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  100 
 
 		 741 aa  1474    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  62.43 
 
 		 759 aa  879    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1807  hypothetical protein  41.81 
 
 		 690 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000440945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  33.44 
 
 		 798 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1923  zinc finger CHC2-family protein  32.23 
 
 		 1118 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.220813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1917  zinc finger CHC2-family protein  32.23 
 
 		 1084 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1997  zinc finger CHC2-family protein  31.72 
 
 		 1086 aa  110  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0307  zinc finger CHC2-family protein  31.72 
 
 		 1086 aa  110  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.293874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  32 
 
 		 842 aa  110  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4786  zinc finger CHC2-family protein  24.45 
 
 		 899 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000150755  normal  0.630286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3701  hypothetical protein  22.81 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3711  hypothetical protein  22.07 
 
 		 556 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2673  hypothetical protein  20 
 
 		 559 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  27.92 
 
 		 867 aa  70.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3643  hypothetical protein  21.89 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0919274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1062 aa  68.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  44.78 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  31.08 
 
 		 725 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3618  hypothetical protein  21.55 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3672  hypothetical protein  22.1 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  42.25 
 
 		 136 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  46.27 
 
 		 141 aa  58.9  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  40.66 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  29.73 
 
 		 880 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1080 aa  54.7  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  26.05 
 
 		 701 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  24.69 
 
 		 868 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  24.69 
 
 		 868 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  24.69 
 
 		 868 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  50 
 
 		 296 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  43.86 
 
 		 312 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1072 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  41.1 
 
 		 895 aa  52  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2651  hypothetical protein  22.89 
 
 		 684 aa  52  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  46.03 
 
 		 278 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  42.11 
 
 		 309 aa  50.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  46.3 
 
 		 696 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  47.69 
 
 		 718 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  25.34 
 
 		 815 aa  48.5  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  46.55 
 
 		 684 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1776 aa  47.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  40.98 
 
 		 293 aa  47.4  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0704  hypothetical protein  25.44 
 
 		 645 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.164472  normal  0.0179361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  27.27 
 
 		 597 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1058 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>