More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4786 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4786  zinc finger CHC2-family protein  100 
 
 		 899 aa  1851    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000150755  normal  0.630286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3701  hypothetical protein  43.18 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2673  hypothetical protein  42.46 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3618  hypothetical protein  42 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3672  hypothetical protein  42.04 
 
 		 556 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3643  hypothetical protein  42.04 
 
 		 556 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0919274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3711  hypothetical protein  42.04 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1917  zinc finger CHC2-family protein  25.42 
 
 		 1084 aa  226  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0307  zinc finger CHC2-family protein  25.92 
 
 		 1086 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.293874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1997  zinc finger CHC2-family protein  25.92 
 
 		 1086 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1923  zinc finger CHC2-family protein  25.11 
 
 		 1118 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.220813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  27.06 
 
 		 582 aa  97.8  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  27.81 
 
 		 584 aa  95.5  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  27.53 
 
 		 577 aa  92  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  27.84 
 
 		 577 aa  91.7  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  29.51 
 
 		 583 aa  91.3  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  29.51 
 
 		 583 aa  91.3  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  28.01 
 
 		 592 aa  89.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  27.06 
 
 		 582 aa  90.1  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  27.06 
 
 		 582 aa  90.1  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  26.54 
 
 		 579 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  26.72 
 
 		 614 aa  90.1  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  25.68 
 
 		 741 aa  89.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  27.06 
 
 		 582 aa  90.1  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  25.86 
 
 		 581 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  25.86 
 
 		 581 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  25.86 
 
 		 581 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  25.86 
 
 		 581 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  25.86 
 
 		 581 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  88.6  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  24.28 
 
 		 581 aa  88.2  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  24.5 
 
 		 581 aa  88.2  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  24.5 
 
 		 581 aa  88.2  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  24.5 
 
 		 581 aa  88.2  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  24.5 
 
 		 581 aa  88.2  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  24.5 
 
 		 581 aa  88.2  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  24.5 
 
 		 581 aa  88.2  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0617  DNA primase  27.12 
 
 		 595 aa  86.3  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.912448  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  30.43 
 
 		 587 aa  86.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  25.27 
 
 		 581 aa  85.9  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  24.28 
 
 		 581 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  25.2 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  24.28 
 
 		 581 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  26.47 
 
 		 584 aa  84.7  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  26.77 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  27.52 
 
 		 594 aa  84.3  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  27.49 
 
 		 571 aa  84  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  25.71 
 
 		 576 aa  84  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3673  hypothetical protein  31.35 
 
 		 187 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  28.83 
 
 		 592 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  26.2 
 
 		 584 aa  83.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  28.43 
 
 		 539 aa  82.4  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  29.34 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  28.93 
 
 		 601 aa  82  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3644  hypothetical protein  30.81 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  27.36 
 
 		 587 aa  81.3  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  27.03 
 
 		 617 aa  80.5  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2672  hypothetical protein  30.27 
 
 		 187 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.139613  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  26.36 
 
 		 582 aa  80.1  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  27.67 
 
 		 577 aa  79.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3619  hypothetical protein  29.27 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  27.49 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  27.56 
 
 		 559 aa  78.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  27.4 
 
 		 578 aa  78.2  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  26.63 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  29.83 
 
 		 564 aa  77.8  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  25.07 
 
 		 584 aa  77.8  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  24.15 
 
 		 583 aa  77.8  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3712  hypothetical protein  28.65 
 
 		 187 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  25.71 
 
 		 624 aa  77  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  27.02 
 
 		 663 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  24.8 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  26.32 
 
 		 553 aa  76.3  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  23.9 
 
 		 588 aa  76.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  26.89 
 
 		 664 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  26.9 
 
 		 573 aa  73.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1072 aa  73.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  27.04 
 
 		 605 aa  73.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  26.07 
 
 		 638 aa  72.8  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  26.09 
 
 		 656 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  25.33 
 
 		 588 aa  73.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  25.49 
 
 		 629 aa  72.4  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  25.21 
 
 		 586 aa  72.4  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  26.24 
 
 		 660 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  23.47 
 
 		 667 aa  71.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  26.88 
 
 		 629 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  25.41 
 
 		 601 aa  70.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  25.5 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  28.17 
 
 		 550 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1807  hypothetical protein  25.68 
 
 		 690 aa  69.7  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000440945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  27.9 
 
 		 605 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  25.12 
 
 		 609 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  25.31 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  24.86 
 
 		 665 aa  69.3  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  25.33 
 
 		 590 aa  69.3  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  23.32 
 
 		 595 aa  69.3  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  25.13 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  22.52 
 
 		 585 aa  68.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  28.19 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  28.2 
 
 		 655 aa  68.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>