17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3643 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3711  hypothetical protein  81.47 
 
 
556 aa  962    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3701  hypothetical protein  69.24 
 
 
559 aa  822    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3672  hypothetical protein  98.02 
 
 
556 aa  1125    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3643  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1145    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0919274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3618  hypothetical protein  92.78 
 
 
556 aa  1072    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2673  hypothetical protein  72.07 
 
 
559 aa  850    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4786  zinc finger CHC2-family protein  42.04 
 
 
899 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000150755  normal  0.630286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0307  zinc finger CHC2-family protein  26.12 
 
 
1086 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.293874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1997  zinc finger CHC2-family protein  26.12 
 
 
1086 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1917  zinc finger CHC2-family protein  26.77 
 
 
1084 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1923  zinc finger CHC2-family protein  26.12 
 
 
1118 aa  150  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.220813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  23.35 
 
 
759 aa  74.7  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1807  hypothetical protein  23.01 
 
 
690 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000440945  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  21.61 
 
 
741 aa  68.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  24.08 
 
 
1080 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  21.69 
 
 
1072 aa  50.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  23.65 
 
 
1058 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>