35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2956 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  100 
 
 
1062 aa  2214    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0370  hypothetical protein  39.23 
 
 
1058 aa  699    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0956297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1383  hypothetical protein  39.52 
 
 
1047 aa  714    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.161884  normal  0.438502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2033  hypothetical protein  37.92 
 
 
1033 aa  672    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923118  normal  0.210395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  41 
 
 
1058 aa  778    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  41.94 
 
 
1080 aa  792    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  52.69 
 
 
1072 aa  1118    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0704  hypothetical protein  44.55 
 
 
645 aa  537  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.164472  normal  0.0179361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2651  hypothetical protein  58.14 
 
 
684 aa  458  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0707  hypothetical protein  46.39 
 
 
291 aa  251  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0151738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  40.63 
 
 
550 aa  244  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0412  hypothetical protein  38.58 
 
 
911 aa  228  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1599  hypothetical protein  52.29 
 
 
245 aa  225  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  30.15 
 
 
799 aa  141  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2652  hypothetical protein  58.24 
 
 
123 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  30.9 
 
 
945 aa  79.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  31.05 
 
 
945 aa  68.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  32.29 
 
 
904 aa  68.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  24.16 
 
 
741 aa  68.2  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1807  hypothetical protein  26.1 
 
 
690 aa  66.6  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000440945  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  31.05 
 
 
879 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  31.05 
 
 
879 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  30.59 
 
 
879 aa  65.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  37.66 
 
 
521 aa  62.4  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2673  hypothetical protein  23.59 
 
 
559 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4786  zinc finger CHC2-family protein  26.47 
 
 
899 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000150755  normal  0.630286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3701  hypothetical protein  23.91 
 
 
559 aa  53.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1917  zinc finger CHC2-family protein  24.07 
 
 
1084 aa  51.6  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1923  zinc finger CHC2-family protein  23.91 
 
 
1118 aa  51.2  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.220813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1997  zinc finger CHC2-family protein  23.46 
 
 
1086 aa  49.3  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0307  zinc finger CHC2-family protein  23.46 
 
 
1086 aa  49.3  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.293874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  32.26 
 
 
571 aa  49.3  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0583  hypothetical protein  31.46 
 
 
212 aa  49.3  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.82779  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  24.32 
 
 
759 aa  48.1  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3618  hypothetical protein  23.74 
 
 
556 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>