29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1383 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2033  hypothetical protein  64.76 
 
 
1033 aa  1328    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923118  normal  0.210395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1383  hypothetical protein  100 
 
 
1047 aa  2160    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.161884  normal  0.438502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  38.81 
 
 
1072 aa  709    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  43.95 
 
 
1080 aa  642    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  37.9 
 
 
1058 aa  654    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0370  hypothetical protein  64.55 
 
 
1058 aa  1331    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0956297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  39.67 
 
 
1062 aa  721    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0704  hypothetical protein  36.02 
 
 
645 aa  383  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.164472  normal  0.0179361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2651  hypothetical protein  34.26 
 
 
684 aa  347  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0707  hypothetical protein  47.14 
 
 
291 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0151738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0412  hypothetical protein  42.6 
 
 
911 aa  241  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  40.74 
 
 
550 aa  226  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1599  hypothetical protein  51.11 
 
 
245 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  33.23 
 
 
799 aa  131  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2039  hypothetical protein  83.58 
 
 
72 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2652  hypothetical protein  58.23 
 
 
123 aa  108  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  30.77 
 
 
945 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  30.37 
 
 
904 aa  72.4  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  30.37 
 
 
879 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  30.37 
 
 
879 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  29.84 
 
 
879 aa  67.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  28.25 
 
 
945 aa  65.1  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  35.42 
 
 
521 aa  60.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  32.98 
 
 
571 aa  54.3  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1917  zinc finger CHC2-family protein  25.53 
 
 
1084 aa  51.2  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1923  zinc finger CHC2-family protein  25 
 
 
1118 aa  50.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.220813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0307  zinc finger CHC2-family protein  25.09 
 
 
1086 aa  49.7  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.293874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1997  zinc finger CHC2-family protein  25.09 
 
 
1086 aa  49.7  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1807  hypothetical protein  24.03 
 
 
690 aa  47  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000440945  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>