31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0964 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  51.86 
 
 
879 aa  828    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  52.09 
 
 
879 aa  829    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  100 
 
 
904 aa  1836    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  52.09 
 
 
879 aa  830    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  68.39 
 
 
945 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  66.06 
 
 
945 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4251  hypothetical protein  31.67 
 
 
541 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2485  hypothetical protein  31.9 
 
 
541 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3843  hypothetical protein  32.14 
 
 
541 aa  147  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5075  hypothetical protein  31.9 
 
 
541 aa  145  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  32.13 
 
 
834 aa  139  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2424  hypothetical protein  29.72 
 
 
966 aa  127  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.660613  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1157  hypothetical protein  30.5 
 
 
893 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  33 
 
 
838 aa  115  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7757  hypothetical protein  28.83 
 
 
885 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4122  hypothetical protein  27.9 
 
 
899 aa  110  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.412369  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1919  hypothetical protein  27.27 
 
 
632 aa  108  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1063  hypothetical protein  32 
 
 
925 aa  106  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0412  hypothetical protein  34.76 
 
 
911 aa  97.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778681  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0306  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.76 
 
 
575 aa  92.8  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1599  hypothetical protein  35.64 
 
 
245 aa  88.2  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  32.57 
 
 
550 aa  83.2  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1383  hypothetical protein  30.37 
 
 
1047 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.161884  normal  0.438502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  31.94 
 
 
1058 aa  72.8  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2033  hypothetical protein  31.22 
 
 
1033 aa  70.5  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923118  normal  0.210395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  31.55 
 
 
1072 aa  70.5  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  31.25 
 
 
1062 aa  68.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0370  hypothetical protein  29.84 
 
 
1058 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0956297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  31.43 
 
 
1080 aa  67.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0707  hypothetical protein  28.95 
 
 
291 aa  66.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0151738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  28.5 
 
 
799 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>