17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2485 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5075  hypothetical protein  97.78 
 
 
541 aa  986    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4251  hypothetical protein  98.71 
 
 
541 aa  1050    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3843  hypothetical protein  98.15 
 
 
541 aa  1048    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2485  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1064    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  46.99 
 
 
834 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  47.66 
 
 
838 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1063  hypothetical protein  36.84 
 
 
925 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1157  hypothetical protein  34.6 
 
 
893 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7757  hypothetical protein  34.06 
 
 
885 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1919  hypothetical protein  33.2 
 
 
632 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2424  hypothetical protein  33.56 
 
 
966 aa  223  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.660613  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  32.62 
 
 
904 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  28.33 
 
 
879 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  29.85 
 
 
879 aa  143  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  27.83 
 
 
879 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4122  hypothetical protein  30.19 
 
 
899 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.412369  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0306  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.86 
 
 
575 aa  70.9  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>