17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1919 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1919  hypothetical protein  100 
 
 
632 aa  1291    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1157  hypothetical protein  31.85 
 
 
893 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2485  hypothetical protein  33.2 
 
 
541 aa  233  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5075  hypothetical protein  33.6 
 
 
541 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4251  hypothetical protein  33.4 
 
 
541 aa  230  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3843  hypothetical protein  33.4 
 
 
541 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  35.99 
 
 
838 aa  229  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  32.32 
 
 
834 aa  225  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1063  hypothetical protein  33.93 
 
 
925 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2424  hypothetical protein  33.26 
 
 
966 aa  205  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.660613  normal 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7757  hypothetical protein  30.12 
 
 
885 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  28.21 
 
 
879 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  27.96 
 
 
879 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  27.71 
 
 
879 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  26.91 
 
 
904 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4122  hypothetical protein  27.6 
 
 
899 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.412369  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0306  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.35 
 
 
575 aa  66.6  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>