19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7757 on replicon NC_011889
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011889  Mnod_7757  hypothetical protein  100 
 
 
885 aa  1793    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  67.82 
 
 
846 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  36.82 
 
 
838 aa  244  6e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  34.88 
 
 
834 aa  228  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3843  hypothetical protein  34.06 
 
 
541 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4251  hypothetical protein  33.86 
 
 
541 aa  221  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5075  hypothetical protein  33.86 
 
 
541 aa  220  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2485  hypothetical protein  34.06 
 
 
541 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1157  hypothetical protein  31.85 
 
 
893 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2424  hypothetical protein  31.85 
 
 
966 aa  157  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.660613  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1063  hypothetical protein  30.53 
 
 
925 aa  151  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1919  hypothetical protein  28.93 
 
 
632 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  28.83 
 
 
904 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  26.29 
 
 
879 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  26.51 
 
 
879 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  29.79 
 
 
879 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4122  hypothetical protein  25.62 
 
 
899 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.412369  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0306  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.63 
 
 
575 aa  55.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1346  hypothetical protein  32.93 
 
 
793 aa  48.5  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>