29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2033 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2033  hypothetical protein  100 
 
 
1033 aa  2129    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923118  normal  0.210395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1383  hypothetical protein  64.64 
 
 
1047 aa  1341    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.161884  normal  0.438502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  38.36 
 
 
1072 aa  674    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  37.51 
 
 
1058 aa  640    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0370  hypothetical protein  61.22 
 
 
1058 aa  1256    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0956297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  38.31 
 
 
1062 aa  679    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  42.09 
 
 
1080 aa  599  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0704  hypothetical protein  35.55 
 
 
645 aa  354  4e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.164472  normal  0.0179361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2651  hypothetical protein  33.04 
 
 
684 aa  313  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0707  hypothetical protein  45.27 
 
 
291 aa  248  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0151738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0412  hypothetical protein  41.57 
 
 
911 aa  237  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  42.57 
 
 
550 aa  232  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1599  hypothetical protein  53.1 
 
 
245 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  33.33 
 
 
799 aa  132  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2039  hypothetical protein  88.06 
 
 
72 aa  124  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2652  hypothetical protein  51.26 
 
 
123 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  30.14 
 
 
945 aa  79.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  28.46 
 
 
945 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  31.22 
 
 
904 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  28.46 
 
 
879 aa  69.3  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  28.46 
 
 
879 aa  68.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  28.05 
 
 
879 aa  68.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  38.75 
 
 
521 aa  66.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  34.04 
 
 
571 aa  55.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0307  zinc finger CHC2-family protein  23.49 
 
 
1086 aa  53.5  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.293874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1997  zinc finger CHC2-family protein  23.49 
 
 
1086 aa  53.5  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1917  zinc finger CHC2-family protein  23.57 
 
 
1084 aa  47.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1923  zinc finger CHC2-family protein  22.93 
 
 
1118 aa  47.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.220813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1807  hypothetical protein  21.29 
 
 
690 aa  47.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000440945  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>