More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0307 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1917  zinc finger CHC2-family protein  93.17 
 
 		 1084 aa  1993    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1923  zinc finger CHC2-family protein  91.32 
 
 		 1118 aa  1999    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.220813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0307  zinc finger CHC2-family protein  100 
 
 		 1086 aa  2211    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.293874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1997  zinc finger CHC2-family protein  100 
 
 		 1086 aa  2211    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4786  zinc finger CHC2-family protein  26.33 
 
 		 899 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000150755  normal  0.630286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3672  hypothetical protein  26.12 
 
 		 556 aa  159  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3643  hypothetical protein  26.12 
 
 		 556 aa  159  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0919274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3618  hypothetical protein  26.79 
 
 		 556 aa  158  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3711  hypothetical protein  27.94 
 
 		 556 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3701  hypothetical protein  28.24 
 
 		 559 aa  153  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2673  hypothetical protein  25.94 
 
 		 559 aa  146  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  24.94 
 
 		 539 aa  132  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  27.37 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  27.53 
 
 		 599 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  29.44 
 
 		 594 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  28.97 
 
 		 613 aa  118  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  28.98 
 
 		 601 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  28.68 
 
 		 581 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  28.68 
 
 		 581 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  28.68 
 
 		 581 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  28.68 
 
 		 581 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  27.61 
 
 		 579 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  28.68 
 
 		 581 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  28.68 
 
 		 581 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  26.22 
 
 		 544 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  28.68 
 
 		 581 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  29.38 
 
 		 581 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  29.38 
 
 		 581 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  29.38 
 
 		 581 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  29.38 
 
 		 581 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  29.38 
 
 		 581 aa  116  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  26.21 
 
 		 535 aa  115  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  28.49 
 
 		 609 aa  114  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  28.37 
 
 		 583 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  28.37 
 
 		 583 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  28.43 
 
 		 581 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  28.43 
 
 		 581 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  29.33 
 
 		 584 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  28.05 
 
 		 645 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  29.54 
 
 		 652 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  25.95 
 
 		 600 aa  112  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  29.07 
 
 		 584 aa  112  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  30.4 
 
 		 655 aa  111  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  28.84 
 
 		 642 aa  111  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  30.02 
 
 		 651 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  28.26 
 
 		 660 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  28.57 
 
 		 582 aa  110  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  26.81 
 
 		 584 aa  110  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  28.54 
 
 		 584 aa  111  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  27.15 
 
 		 583 aa  110  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  25.7 
 
 		 598 aa  109  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  26.45 
 
 		 582 aa  109  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  25.7 
 
 		 598 aa  109  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  28.65 
 
 		 626 aa  109  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  25.7 
 
 		 598 aa  109  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  25.7 
 
 		 598 aa  109  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  27.74 
 
 		 582 aa  108  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  26.23 
 
 		 640 aa  108  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  25.7 
 
 		 598 aa  109  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  25.7 
 
 		 598 aa  109  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  28.88 
 
 		 581 aa  109  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  27.74 
 
 		 582 aa  108  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  27.74 
 
 		 582 aa  108  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  25.7 
 
 		 571 aa  108  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  25.45 
 
 		 598 aa  108  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  25.7 
 
 		 598 aa  108  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  27.91 
 
 		 588 aa  108  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  27.74 
 
 		 660 aa  108  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  27.74 
 
 		 660 aa  108  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  29.2 
 
 		 660 aa  108  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  30 
 
 		 577 aa  108  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  32.09 
 
 		 741 aa  107  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  29.38 
 
 		 664 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  26.76 
 
 		 586 aa  107  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  28.54 
 
 		 584 aa  107  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  30 
 
 		 638 aa  107  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  28.45 
 
 		 601 aa  107  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  26.48 
 
 		 640 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  28.81 
 
 		 576 aa  107  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  29.04 
 
 		 598 aa  107  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  29.01 
 
 		 619 aa  106  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  27.57 
 
 		 571 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  28.41 
 
 		 575 aa  106  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  26.68 
 
 		 582 aa  105  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  27.25 
 
 		 604 aa  106  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  26.06 
 
 		 674 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  27.55 
 
 		 593 aa  105  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  29.19 
 
 		 663 aa  105  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  26.11 
 
 		 550 aa  104  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  26.13 
 
 		 577 aa  104  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  24.11 
 
 		 579 aa  105  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  30.64 
 
 		 605 aa  104  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  26.13 
 
 		 577 aa  104  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  26.46 
 
 		 655 aa  104  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  28.37 
 
 		 565 aa  104  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 604 aa  104  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  28.13 
 
 		 573 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  26.29 
 
 		 595 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  24.74 
 
 		 598 aa  104  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  27.78 
 
 		 584 aa  104  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>