30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0370 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  39.22 
 
 
1072 aa  694    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2033  hypothetical protein  61.22 
 
 
1033 aa  1236    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923118  normal  0.210395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  39.23 
 
 
1062 aa  699    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0370  hypothetical protein  100 
 
 
1058 aa  2174    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0956297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1383  hypothetical protein  64.55 
 
 
1047 aa  1324    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.161884  normal  0.438502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  37.67 
 
 
1058 aa  630  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  35.87 
 
 
1080 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0704  hypothetical protein  36.91 
 
 
645 aa  392  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.164472  normal  0.0179361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2651  hypothetical protein  33.86 
 
 
684 aa  352  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0707  hypothetical protein  46.62 
 
 
291 aa  252  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0151738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0412  hypothetical protein  42.49 
 
 
911 aa  241  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1599  hypothetical protein  52.23 
 
 
245 aa  224  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  41.43 
 
 
550 aa  221  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  33.23 
 
 
799 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2652  hypothetical protein  61.18 
 
 
123 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2039  hypothetical protein  74.63 
 
 
72 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  29.41 
 
 
945 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  41.25 
 
 
521 aa  67.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  28.57 
 
 
945 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  29.84 
 
 
879 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  29.84 
 
 
879 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  29.84 
 
 
904 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  29.32 
 
 
879 aa  65.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0307  zinc finger CHC2-family protein  25.63 
 
 
1086 aa  55.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.293874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1997  zinc finger CHC2-family protein  25.63 
 
 
1086 aa  55.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  27.22 
 
 
571 aa  53.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1917  zinc finger CHC2-family protein  25.25 
 
 
1084 aa  51.6  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1923  zinc finger CHC2-family protein  23.51 
 
 
1118 aa  50.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.220813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1807  hypothetical protein  23.04 
 
 
690 aa  50.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000440945  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0583  hypothetical protein  30.11 
 
 
212 aa  47  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.82779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>