24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1025 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  100 
 
 
945 aa  1926    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  72.48 
 
 
945 aa  1388    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  81.82 
 
 
879 aa  561  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  81.82 
 
 
879 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  81.82 
 
 
879 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0630  DNA primase catalytic core domain protein  45.47 
 
 
1026 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0772  DNA primase catalytic core domain protein  45.47 
 
 
1026 aa  489  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  68.39 
 
 
904 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  23.81 
 
 
851 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1888  hypothetical protein  21.25 
 
 
527 aa  99  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0412  hypothetical protein  32.62 
 
 
911 aa  92.8  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778681  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  33.33 
 
 
1058 aa  90.5  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  33.05 
 
 
550 aa  84  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  30.85 
 
 
1072 aa  82  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0707  hypothetical protein  30.18 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0151738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1599  hypothetical protein  31.73 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1383  hypothetical protein  30.77 
 
 
1047 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.161884  normal  0.438502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2033  hypothetical protein  30.14 
 
 
1033 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923118  normal  0.210395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  30.9 
 
 
1062 aa  79.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0370  hypothetical protein  28.22 
 
 
1058 aa  77.4  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0956297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  29.29 
 
 
799 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  30 
 
 
1080 aa  72.8  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1898  phage-like protein  27.36 
 
 
902 aa  45.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186879  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0166  zinc finger CHC2-family protein  28.74 
 
 
930 aa  44.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>