77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3752 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  100 
 
 
799 aa  1650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  34.7 
 
 
1072 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  31.91 
 
 
738 aa  147  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  31.77 
 
 
470 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1599  hypothetical protein  43.88 
 
 
245 aa  143  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  30.15 
 
 
1062 aa  141  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  33.67 
 
 
843 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  34 
 
 
842 aa  140  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  32.92 
 
 
755 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0412  hypothetical protein  35.15 
 
 
911 aa  137  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778681  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0370  hypothetical protein  33.23 
 
 
1058 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0956297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  30.71 
 
 
760 aa  135  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  31.83 
 
 
798 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  31.83 
 
 
695 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  33.63 
 
 
1080 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2033  hypothetical protein  33.33 
 
 
1033 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923118  normal  0.210395 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  34.7 
 
 
482 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1383  hypothetical protein  33.23 
 
 
1047 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.161884  normal  0.438502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  34.16 
 
 
765 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  29.91 
 
 
759 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  32.75 
 
 
462 aa  128  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0707  hypothetical protein  35.98 
 
 
291 aa  125  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0151738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  30.73 
 
 
749 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  31.81 
 
 
467 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  32.84 
 
 
472 aa  119  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  31.3 
 
 
485 aa  114  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  30.07 
 
 
717 aa  114  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  30.07 
 
 
717 aa  114  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  29.73 
 
 
717 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  30.42 
 
 
450 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  29.03 
 
 
774 aa  109  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  30.87 
 
 
550 aa  108  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  29.21 
 
 
725 aa  108  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  30.34 
 
 
697 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  28.78 
 
 
554 aa  106  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  31.5 
 
 
1058 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  28.34 
 
 
782 aa  103  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  34.7 
 
 
479 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  25.8 
 
 
857 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  28.92 
 
 
526 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  26.24 
 
 
900 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  28.92 
 
 
526 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  28.45 
 
 
524 aa  101  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  27.58 
 
 
874 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  27.58 
 
 
874 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  28.43 
 
 
746 aa  97.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  28.43 
 
 
746 aa  97.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  26.27 
 
 
770 aa  90.9  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  28.52 
 
 
612 aa  82.8  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  24.38 
 
 
613 aa  81.6  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  27 
 
 
624 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  23.73 
 
 
788 aa  78.2  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  28.46 
 
 
757 aa  75.1  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  27.93 
 
 
723 aa  73.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  29.29 
 
 
945 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  28.81 
 
 
531 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  26.39 
 
 
882 aa  66.6  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  27.18 
 
 
945 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  29.19 
 
 
904 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  25.22 
 
 
955 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  27.23 
 
 
879 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  27.23 
 
 
879 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  27.23 
 
 
879 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  26.07 
 
 
769 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  24.6 
 
 
1117 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  23.34 
 
 
1145 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  23 
 
 
606 aa  51.2  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  22.9 
 
 
1285 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  26.4 
 
 
828 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  24.47 
 
 
624 aa  48.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  28.46 
 
 
1061 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  23.03 
 
 
632 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  23.08 
 
 
1000 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  21.64 
 
 
1172 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  21.34 
 
 
1172 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  25.57 
 
 
771 aa  45.8  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  24.88 
 
 
501 aa  45.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>